More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5274 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 377 aa  751    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  69.4 
 
 		 392 aa  510  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  62.12 
 
 		 396 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  62.05 
 
 		 369 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  62.4 
 
 		 361 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  61 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  61 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  61 
 
 		 369 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  59.72 
 
 		 370 aa  420  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  60.11 
 
 		 403 aa  414  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  60.11 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  60.11 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  60.11 
 
 		 371 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  59.83 
 
 		 371 aa  410  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  59.53 
 
 		 394 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.78 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  61.32 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  35.41 
 
 		 374 aa  176  6e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  38.52 
 
 		 370 aa  176  7e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  37.15 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  35.81 
 
 		 390 aa  171  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.65 
 
 		 377 aa  170  5e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  32.67 
 
 		 369 aa  169  7e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  39.87 
 
 		 359 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.53 
 
 		 381 aa  167  4e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  37.07 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  34.49 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  35.61 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 523 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.38 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  33.12 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  36.31 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 362 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 367 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 362 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 379 aa  160  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.21 
 
 		 357 aa  159  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.25 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  34.55 
 
 		 368 aa  158  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.98 
 
 		 371 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.51 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  34.02 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.43 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 357 aa  151  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.51 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.2 
 
 		 356 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 374 aa  150  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  33.88 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.47 
 
 		 383 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  37.22 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.47 
 
 		 367 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 362 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 367 aa  146  6e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  33.94 
 
 		 360 aa  146  7.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32.39 
 
 		 366 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  32.59 
 
 		 368 aa  145  9e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  32.39 
 
 		 374 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.18 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  32.1 
 
 		 357 aa  143  4e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  34.18 
 
 		 361 aa  143  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.52 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 398 aa  143  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 361 aa  142  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  34.5 
 
 		 387 aa  142  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 365 aa  142  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 394 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  33.14 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  35.54 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 368 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 383 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  32.87 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  34.5 
 
 		 366 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.5 
 
 		 366 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 372 aa  138  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  32.66 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.53 
 
 		 368 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  32.21 
 
 		 368 aa  136  5e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.77 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.98 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  30.3 
 
 		 363 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  32.2 
 
 		 356 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  31.21 
 
 		 358 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  31.92 
 
 		 375 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 417 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 371 aa  133  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  29.81 
 
 		 358 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.55 
 
 		 361 aa  132  9e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  31.3 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>