More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01940 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  94.55 
 
 		 367 aa  672    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  100 
 
 		 383 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.35 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  59.3 
 
 		 372 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  54.55 
 
 		 367 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  56.69 
 
 		 362 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.94 
 
 		 362 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  58.13 
 
 		 362 aa  334  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  58.61 
 
 		 362 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.37 
 
 		 395 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  48.1 
 
 		 374 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  50.43 
 
 		 395 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  45.72 
 
 		 363 aa  301  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  49.85 
 
 		 351 aa  301  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  46.25 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  46.25 
 
 		 372 aa  299  5e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  46.38 
 
 		 394 aa  287  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.4 
 
 		 388 aa  288  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.99 
 
 		 362 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.09 
 
 		 383 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.18 
 
 		 361 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  45.54 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  48.03 
 
 		 371 aa  273  5.000000000000001e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  44.93 
 
 		 387 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  45.08 
 
 		 369 aa  265  1e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.19 
 
 		 357 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  40.6 
 
 		 357 aa  242  7e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 357 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  40.48 
 
 		 374 aa  225  9e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  40.29 
 
 		 369 aa  222  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.68 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.49 
 
 		 360 aa  215  8e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  39.44 
 
 		 361 aa  203  4e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  40.28 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.03 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  39.2 
 
 		 378 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  39.34 
 
 		 360 aa  190  5e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  37.87 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.47 
 
 		 356 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  37.32 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  36.84 
 
 		 367 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  35.93 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.32 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.51 
 
 		 367 aa  179  9e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.86 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 366 aa  176  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 390 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.9 
 
 		 417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 366 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  36.6 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 397 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  40.35 
 
 		 398 aa  169  6e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.76 
 
 		 356 aa  169  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  38.18 
 
 		 387 aa  168  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  34.39 
 
 		 358 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.42 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  34.28 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 365 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.62 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 357 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  33.77 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  35.91 
 
 		 369 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 369 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  35.14 
 
 		 402 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  36.06 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  34.22 
 
 		 355 aa  163  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 385 aa  163  6e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 416 aa  162  8.000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 369 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.77 
 
 		 361 aa  162  9e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.66 
 
 		 379 aa  162  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  35.99 
 
 		 396 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 355 aa  160  3e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  35.33 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  36.45 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.84 
 
 		 402 aa  159  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  35.4 
 
 		 368 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 383 aa  156  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  36.05 
 
 		 374 aa  155  1e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.66 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  32.75 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 370 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.83 
 
 		 361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  37.42 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  34.51 
 
 		 357 aa  153  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 361 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 		 365 aa  152  1e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  31.88 
 
 		 523 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 354 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 		 403 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.93 
 
 		 355 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  34.32 
 
 		 368 aa  151  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  32.88 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>