More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4927 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 354 aa  693    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  61.49 
 
 		 358 aa  419  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.54 
 
 		 357 aa  348  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  53.8 
 
 		 358 aa  338  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  51.3 
 
 		 357 aa  334  2e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  53.41 
 
 		 357 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  48 
 
 		 368 aa  312  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.02 
 
 		 361 aa  293  3e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  46.33 
 
 		 369 aa  292  7e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.17 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  43.02 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  44.57 
 
 		 361 aa  242  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.61 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.98 
 
 		 384 aa  236  7e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  38.31 
 
 		 356 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  42.82 
 
 		 364 aa  228  2e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.27 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  40.58 
 
 		 387 aa  222  8e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  38.08 
 
 		 356 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  36.16 
 
 		 354 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  36.8 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 355 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  36.65 
 
 		 355 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  40.85 
 
 		 374 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.1 
 
 		 367 aa  188  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.96 
 
 		 366 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  36.36 
 
 		 355 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  35.33 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  38.1 
 
 		 361 aa  182  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 356 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 361 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 360 aa  176  6e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  33.43 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.84 
 
 		 388 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 387 aa  162  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 394 aa  161  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  34.46 
 
 		 374 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.02 
 
 		 381 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 383 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 367 aa  159  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  32.45 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 377 aa  156  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.05 
 
 		 402 aa  156  6e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.83 
 
 		 379 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.41 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.07 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  34.2 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  34.07 
 
 		 367 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 361 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.87 
 
 		 402 aa  153  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  35.8 
 
 		 374 aa  152  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  33.04 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  38.17 
 
 		 402 aa  150  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  31.56 
 
 		 371 aa  151  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 369 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.92 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 361 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.85 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  34.46 
 
 		 372 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  37.68 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 366 aa  148  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  36.26 
 
 		 368 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  32.65 
 
 		 360 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  32.46 
 
 		 367 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 403 aa  146  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  30.88 
 
 		 363 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  32.76 
 
 		 351 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.91 
 
 		 361 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 371 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 371 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.01 
 
 		 366 aa  142  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 395 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.9 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 357 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.14 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  35 
 
 		 365 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  34.86 
 
 		 368 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  32.69 
 
 		 523 aa  139  8.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 362 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  33.77 
 
 		 359 aa  137  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 362 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 363 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.83 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.28 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.85 
 
 		 357 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>