More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0288 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 355 aa  706    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  86.48 
 
 		 355 aa  590  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  86.48 
 
 		 355 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  86.48 
 
 		 355 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  70.25 
 
 		 354 aa  474  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  68.93 
 
 		 356 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  68.64 
 
 		 361 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  61.08 
 
 		 356 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  59.89 
 
 		 356 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.7 
 
 		 366 aa  299  6e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  43.91 
 
 		 363 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  44 
 
 		 368 aa  278  8e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  46.15 
 
 		 361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.67 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  40.74 
 
 		 357 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  43.59 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.53 
 
 		 384 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  39.88 
 
 		 358 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  39.71 
 
 		 357 aa  232  9e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  39.77 
 
 		 364 aa  227  3e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.32 
 
 		 357 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.42 
 
 		 383 aa  226  7e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  40 
 
 		 387 aa  223  4e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  40.79 
 
 		 364 aa  220  3e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.03 
 
 		 361 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  37.68 
 
 		 361 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 		 362 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 354 aa  204  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  37.46 
 
 		 358 aa  203  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 		 360 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  34.91 
 
 		 363 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 369 aa  186  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.74 
 
 		 367 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  36.16 
 
 		 374 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  38.11 
 
 		 378 aa  179  4.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  38.36 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  34.29 
 
 		 363 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.99 
 
 		 379 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 		 402 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 402 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  36.12 
 
 		 405 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  36.12 
 
 		 360 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  37.13 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  35.84 
 
 		 374 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  34.08 
 
 		 523 aa  168  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  35.86 
 
 		 394 aa  167  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  34.59 
 
 		 368 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  33.66 
 
 		 371 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  34.37 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  36.1 
 
 		 418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.2 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.31 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.54 
 
 		 398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  33.92 
 
 		 402 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  34.64 
 
 		 396 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 377 aa  162  6e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.02 
 
 		 381 aa  162  7e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 368 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  36.29 
 
 		 366 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  32.39 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  36.23 
 
 		 365 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 351 aa  160  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 370 aa  159  8e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 363 aa  157  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 369 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.8 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 403 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 384 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.23 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  33.89 
 
 		 371 aa  155  7e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3506  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 364 aa  155  9e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164445  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.99 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.05 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  34.36 
 
 		 390 aa  154  2.9999999999999998e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  32.87 
 
 		 367 aa  153  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 368 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  32.86 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 371 aa  153  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.57 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  32.15 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  30.69 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  33.44 
 
 		 367 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  30.69 
 
 		 372 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.61 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>