More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2826 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 396 aa  770    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  49.38 
 
 		 365 aa  282  9e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  45.87 
 
 		 368 aa  279  8e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.89 
 
 		 371 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  50.73 
 
 		 365 aa  266  4e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  45.77 
 
 		 374 aa  266  4e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  48.61 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.58 
 
 		 368 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  43.35 
 
 		 394 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  44.85 
 
 		 368 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.25 
 
 		 369 aa  258  9e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  40.34 
 
 		 367 aa  233  5e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  41.56 
 
 		 363 aa  212  1e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  39.1 
 
 		 405 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.58 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  41.05 
 
 		 361 aa  202  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  39.95 
 
 		 371 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  39.07 
 
 		 367 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 523 aa  199  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.69 
 
 		 361 aa  199  9e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  39.36 
 
 		 367 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.95 
 
 		 379 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 		 418 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  39.78 
 
 		 375 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 369 aa  195  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  39.71 
 
 		 368 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  42.3 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  38.63 
 
 		 369 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  36.44 
 
 		 371 aa  193  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  36.06 
 
 		 390 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  38.04 
 
 		 384 aa  190  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 367 aa  190  5e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  38.27 
 
 		 378 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 379 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  37.42 
 
 		 367 aa  188  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  36.81 
 
 		 396 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.22 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  39.06 
 
 		 371 aa  186  5e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.29 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.75 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.61 
 
 		 370 aa  186  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  36.81 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 369 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  38.42 
 
 		 369 aa  185  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  38.63 
 
 		 370 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  38.84 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.61 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  39.77 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.93 
 
 		 367 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  39.77 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 369 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  38.98 
 
 		 348 aa  184  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 403 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  37.92 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  35.31 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 369 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.59 
 
 		 356 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.39 
 
 		 371 aa  181  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  35.08 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  38.23 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 355 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  41.31 
 
 		 359 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  38.58 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  35.45 
 
 		 364 aa  180  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  38.4 
 
 		 367 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  36.87 
 
 		 361 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  37.72 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 371 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  39.12 
 
 		 370 aa  178  2e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.76 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  38.15 
 
 		 371 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  38.4 
 
 		 374 aa  177  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.67 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  41.5 
 
 		 393 aa  176  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.75 
 
 		 356 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  38.29 
 
 		 357 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.09 
 
 		 398 aa  173  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  38.25 
 
 		 374 aa  172  6.999999999999999e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 416 aa  172  9e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.53 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  37.32 
 
 		 355 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 387 aa  171  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  37.57 
 
 		 358 aa  170  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  38.61 
 
 		 361 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  35.26 
 
 		 358 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 		 369 aa  169  9e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  37.19 
 
 		 363 aa  168  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.53 
 
 		 370 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3506  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 364 aa  166  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.18 
 
 		 366 aa  166  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  35.77 
 
 		 395 aa  166  9e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  35.99 
 
 		 371 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37 
 
 		 357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.22 
 
 		 383 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>