More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0821 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 371 aa  738    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  69.54 
 
 		 371 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  67.65 
 
 		 369 aa  464  1e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  68.35 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  66.04 
 
 		 375 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  68.46 
 
 		 371 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  68.45 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  68.45 
 
 		 374 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  69.27 
 
 		 369 aa  436  1e-121  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  62.53 
 
 		 369 aa  434  1e-120  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  67.38 
 
 		 374 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  69.09 
 
 		 369 aa  432  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.1 
 
 		 371 aa  426  1e-118  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.61 
 
 		 371 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.37 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  61.45 
 
 		 368 aa  405  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.29 
 
 		 369 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  60.48 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  61.29 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  62.25 
 
 		 367 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  61.69 
 
 		 367 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  61.24 
 
 		 367 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  60.43 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  55.34 
 
 		 348 aa  338  9e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.16 
 
 		 366 aa  325  1e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  52.44 
 
 		 371 aa  299  5e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.05 
 
 		 370 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  45.94 
 
 		 363 aa  266  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.27 
 
 		 361 aa  263  3e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  46.06 
 
 		 361 aa  261  2e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.77 
 
 		 361 aa  258  1e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  36.89 
 
 		 368 aa  215  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  37.33 
 
 		 374 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  37.93 
 
 		 365 aa  196  6e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  40.44 
 
 		 365 aa  192  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.38 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.1 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  37.1 
 
 		 396 aa  181  2e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 368 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.86 
 
 		 368 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  35.28 
 
 		 394 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 		 418 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  35.08 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  35.16 
 
 		 378 aa  169  9e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 405 aa  165  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 367 aa  159  8e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  37.38 
 
 		 416 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 398 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  37.94 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  33.44 
 
 		 367 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 402 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.46 
 
 		 402 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  34.4 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  33.61 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  30.9 
 
 		 350 aa  151  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.83 
 
 		 360 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  35.74 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 392 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.32 
 
 		 369 aa  150  4e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  33.7 
 
 		 390 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 		 361 aa  149  8e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.06 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 370 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 393 aa  148  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.58 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.78 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  33.81 
 
 		 402 aa  146  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 387 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.77 
 
 		 386 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 357 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  31.58 
 
 		 374 aa  145  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 366 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.64 
 
 		 379 aa  145  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  34.47 
 
 		 366 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  32.79 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 369 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.22 
 
 		 379 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.44 
 
 		 384 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 383 aa  142  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 366 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.02 
 
 		 397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 383 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  30.77 
 
 		 371 aa  137  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  33.15 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.7 
 
 		 370 aa  137  4e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 387 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.12 
 
 		 383 aa  137  4e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 370 aa  136  5e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.69 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  32.27 
 
 		 372 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 374 aa  135  8e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  31.88 
 
 		 368 aa  135  8e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>