More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2041 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  100 
 
 		 374 aa  746    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  66.47 
 
 		 351 aa  421  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  59.65 
 
 		 363 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  55.96 
 
 		 371 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  58.43 
 
 		 363 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.71 
 
 		 362 aa  363  3e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  48.1 
 
 		 383 aa  308  8e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  48.1 
 
 		 367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  46.71 
 
 		 372 aa  295  9e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  46.71 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.61 
 
 		 357 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.89 
 
 		 357 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  47.52 
 
 		 362 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.85 
 
 		 361 aa  280  2e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  44.9 
 
 		 367 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.23 
 
 		 362 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  46.28 
 
 		 369 aa  279  5e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.93 
 
 		 388 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  47.81 
 
 		 362 aa  276  4e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  47.16 
 
 		 362 aa  275  8e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  43.95 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  47.21 
 
 		 367 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  42.15 
 
 		 394 aa  272  6e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.15 
 
 		 383 aa  271  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  44.31 
 
 		 387 aa  268  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.8 
 
 		 372 aa  265  1e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  44.51 
 
 		 372 aa  263  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.34 
 
 		 395 aa  262  6e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  43.49 
 
 		 369 aa  255  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  41.28 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.55 
 
 		 360 aa  229  7e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.32 
 
 		 367 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  40.47 
 
 		 361 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.12 
 
 		 381 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  41.88 
 
 		 374 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  39.6 
 
 		 358 aa  199  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  39.81 
 
 		 360 aa  191  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  36.34 
 
 		 364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  36.93 
 
 		 357 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 418 aa  188  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  34.08 
 
 		 358 aa  186  7e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.01 
 
 		 356 aa  186  8e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.77 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  33.14 
 
 		 354 aa  183  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  36.52 
 
 		 355 aa  182  6e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  35.47 
 
 		 357 aa  182  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 369 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.25 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 		 402 aa  180  4e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  37.42 
 
 		 355 aa  180  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 392 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  34.17 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.67 
 
 		 361 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 369 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  35.1 
 
 		 355 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  35.64 
 
 		 368 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  35.56 
 
 		 355 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.58 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 362 aa  176  6e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.9 
 
 		 402 aa  176  6e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 369 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  33.05 
 
 		 396 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  38.04 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  34.45 
 
 		 402 aa  172  9e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  35.46 
 
 		 358 aa  171  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 		 356 aa  171  2e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.92 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.01 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  36.55 
 
 		 361 aa  169  6e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.06 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  32.31 
 
 		 371 aa  167  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 368 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  34.08 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  33.05 
 
 		 523 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 		 417 aa  165  9e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  34.55 
 
 		 354 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 365 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  33.12 
 
 		 367 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 396 aa  162  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  33.66 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  35.26 
 
 		 378 aa  161  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  33.63 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.2 
 
 		 379 aa  160  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  31.46 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 		 403 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 385 aa  159  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.47 
 
 		 367 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 365 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 366 aa  157  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 370 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.96 
 
 		 397 aa  154  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  32.07 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>