More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5367 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 357 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.6 
 
 		 357 aa  659    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  51.9 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  49.4 
 
 		 357 aa  309  4e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  50 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  47.89 
 
 		 374 aa  293  3e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.32 
 
 		 361 aa  286  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  45 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.23 
 
 		 362 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.72 
 
 		 383 aa  280  4e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.11 
 
 		 388 aa  276  4e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  47.65 
 
 		 371 aa  273  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  48.06 
 
 		 367 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  48.53 
 
 		 372 aa  271  1e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  48.53 
 
 		 372 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  50.81 
 
 		 351 aa  267  2e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  44.89 
 
 		 387 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  45.77 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  45.48 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  47.27 
 
 		 362 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  46.73 
 
 		 362 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.85 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  46.61 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  45.4 
 
 		 372 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.29 
 
 		 372 aa  240  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  42.46 
 
 		 367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  46.75 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.53 
 
 		 395 aa  232  6e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.47 
 
 		 367 aa  220  3e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  39.88 
 
 		 369 aa  219  5e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  42.25 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  41.23 
 
 		 360 aa  212  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  41.29 
 
 		 395 aa  210  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.13 
 
 		 356 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  37.43 
 
 		 361 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.6 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.09 
 
 		 356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  36.97 
 
 		 358 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  33.99 
 
 		 358 aa  178  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.98 
 
 		 356 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 367 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 381 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  37.91 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  36.53 
 
 		 368 aa  170  4e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  36.84 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.56 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 		 355 aa  169  7e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  38.25 
 
 		 391 aa  169  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 383 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.19 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  36.01 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 354 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  36.01 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  33.12 
 
 		 367 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 369 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 355 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.84 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  37.72 
 
 		 361 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.68 
 
 		 379 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  35.38 
 
 		 364 aa  162  9e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  33.43 
 
 		 355 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  35.57 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 		 357 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  34.84 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  35.65 
 
 		 394 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.72 
 
 		 357 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 		 383 aa  158  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 366 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  35.75 
 
 		 387 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 396 aa  157  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 368 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.13 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 355 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 		 392 aa  156  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  34.66 
 
 		 375 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 357 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.04 
 
 		 368 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.85 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  35.26 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.26 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 396 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 398 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 371 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  35.41 
 
 		 358 aa  152  8.999999999999999e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.18 
 
 		 402 aa  152  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.74 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  31.56 
 
 		 363 aa  150  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  34.82 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>