More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5088 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 361 aa  710    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  91.44 
 
 		 362 aa  601  1.0000000000000001e-171  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  53.19 
 
 		 358 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  50.29 
 
 		 364 aa  325  5e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.9 
 
 		 357 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  50.14 
 
 		 357 aa  309  5e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  45.22 
 
 		 368 aa  308  9e-83  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  49.13 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  48.02 
 
 		 354 aa  301  1e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  49.3 
 
 		 357 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  44.19 
 
 		 369 aa  289  6e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.67 
 
 		 384 aa  278  1e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  48.07 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.97 
 
 		 357 aa  269  5e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  42.15 
 
 		 387 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  45.48 
 
 		 364 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.06 
 
 		 383 aa  262  8e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  41.41 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  40.96 
 
 		 356 aa  239  6.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  38.87 
 
 		 355 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  37.75 
 
 		 354 aa  224  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  38.03 
 
 		 355 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 355 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 355 aa  215  9e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  42.17 
 
 		 374 aa  215  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.41 
 
 		 356 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.65 
 
 		 367 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  37.6 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  39.17 
 
 		 361 aa  206  7e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 366 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.35 
 
 		 388 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  40.11 
 
 		 366 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  34.63 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  37.25 
 
 		 394 aa  194  3e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 361 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.75 
 
 		 383 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.72 
 
 		 377 aa  189  5.999999999999999e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.21 
 
 		 360 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  38.92 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  35.67 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  38.07 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  36.45 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  38.86 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  36.48 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 403 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  35.67 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.59 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  35.39 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 381 aa  177  3e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 367 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  36.94 
 
 		 363 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  34.08 
 
 		 367 aa  169  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  35.44 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  35.36 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  38.56 
 
 		 363 aa  164  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.39 
 
 		 372 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.59 
 
 		 362 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  32.51 
 
 		 358 aa  162  6e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 		 351 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  35.76 
 
 		 370 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  33.12 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  33.12 
 
 		 372 aa  160  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.72 
 
 		 357 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  35.09 
 
 		 362 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  34.69 
 
 		 365 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.83 
 
 		 383 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  34.5 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.08 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  35.03 
 
 		 390 aa  154  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  32.07 
 
 		 523 aa  154  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.08 
 
 		 359 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.54 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 357 aa  152  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  33.99 
 
 		 367 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  34.59 
 
 		 402 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.17 
 
 		 402 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  31.9 
 
 		 357 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.02 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.48 
 
 		 402 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.77 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  33.98 
 
 		 368 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.48 
 
 		 367 aa  149  6e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.25 
 
 		 367 aa  149  7e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  31.25 
 
 		 367 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  31.86 
 
 		 394 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  33.54 
 
 		 362 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  32.59 
 
 		 374 aa  146  6e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>