More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_01960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  96.07 
 
 
356 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  100 
 
 
356 aa  699    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  58.86 
 
 
354 aa  394  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  60.71 
 
 
355 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.7 
 
 
356 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  59.89 
 
 
355 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  60.17 
 
 
355 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  59.89 
 
 
355 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  61.54 
 
 
361 aa  359  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.57 
 
 
366 aa  305  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  45.88 
 
 
363 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.49 
 
 
357 aa  279  7e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  46.61 
 
 
361 aa  275  7e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  45.15 
 
 
368 aa  272  5.000000000000001e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  40.68 
 
 
357 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.7 
 
 
384 aa  247  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  40.62 
 
 
369 aa  239  5e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  39.59 
 
 
358 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.86 
 
 
357 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  40.46 
 
 
364 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.96 
 
 
361 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  43.68 
 
 
364 aa  233  3e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.71 
 
 
383 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  39.26 
 
 
357 aa  228  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  42.31 
 
 
387 aa  225  8e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.83 
 
 
367 aa  223  3e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.83 
 
 
360 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  40.28 
 
 
358 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  38.66 
 
 
354 aa  219  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.61 
 
 
362 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  37.78 
 
 
369 aa  215  8e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  40.43 
 
 
374 aa  212  7.999999999999999e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  39.88 
 
 
361 aa  205  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.38 
 
 
388 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.24 
 
 
381 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 
394 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.69 
 
 
383 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 
377 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  39.07 
 
 
360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  36.84 
 
 
363 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  38.49 
 
 
367 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.28 
 
 
372 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  36.13 
 
 
372 aa  186  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.57 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  34.67 
 
 
367 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  38.03 
 
 
387 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  36.44 
 
 
374 aa  180  4e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  33.62 
 
 
372 aa  178  1e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  33.62 
 
 
372 aa  177  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.7 
 
 
361 aa  177  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  37.79 
 
 
362 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.17 
 
 
362 aa  175  8e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.58 
 
 
383 aa  175  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  34.37 
 
 
367 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.28 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 
362 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.43 
 
 
379 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 
361 aa  171  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 
402 aa  171  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 
418 aa  171  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  35.67 
 
 
363 aa  170  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  35.34 
 
 
369 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.04 
 
 
395 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  35.29 
 
 
402 aa  169  9e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  35.86 
 
 
405 aa  169  9e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 
402 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  34.8 
 
 
371 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 
362 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 
383 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 
396 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 
379 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  35.98 
 
 
374 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  34.77 
 
 
396 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 
351 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  33.82 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.75 
 
 
357 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 
362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 
369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2654  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 
366 aa  164  3e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 
416 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  36.89 
 
 
359 aa  162  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  33.43 
 
 
368 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
369 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 
369 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.64 
 
 
417 aa  161  2e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 
403 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  31.2 
 
 
358 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 
365 aa  160  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  36.1 
 
 
363 aa  159  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  34.32 
 
 
365 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 
371 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  36.26 
 
 
378 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 
384 aa  157  2e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  37.11 
 
 
363 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 
371 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 
371 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.08 
 
 
398 aa  157  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  33.62 
 
 
394 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 
371 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  35.61 
 
 
390 aa  156  4e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>