More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3411 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  100 
 
 		 363 aa  726    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  79.61 
 
 		 363 aa  567  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.32 
 
 		 362 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  59.65 
 
 		 374 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4926  RND family efflux transporter MFP subunit  58.69 
 
 		 351 aa  378  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  57.49 
 
 		 371 aa  365  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.28 
 
 		 357 aa  310  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.13 
 
 		 357 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.31 
 
 		 361 aa  298  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  48.29 
 
 		 372 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  47.72 
 
 		 394 aa  296  5e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  48.29 
 
 		 372 aa  296  5e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.72 
 
 		 383 aa  295  6e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4858  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.26 
 
 		 388 aa  293  3e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.368814  normal  0.345614 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  47.95 
 
 		 367 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2782  RND family efflux transporter MFP subunit  46.09 
 
 		 387 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 367 aa  290  3e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  45.75 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  43.36 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  48.69 
 
 		 369 aa  272  8.000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  43.19 
 
 		 367 aa  266  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  45.48 
 
 		 372 aa  264  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.48 
 
 		 372 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  43.43 
 
 		 362 aa  259  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.86 
 
 		 362 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  45.48 
 
 		 362 aa  256  3e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  44.72 
 
 		 362 aa  252  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.05 
 
 		 395 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  39.2 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  39.03 
 
 		 395 aa  232  8.000000000000001e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.52 
 
 		 367 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.81 
 
 		 360 aa  215  9e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  39.82 
 
 		 374 aa  212  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.22 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.11 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  38.53 
 
 		 360 aa  194  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.26 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  37.28 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  36.31 
 
 		 358 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.42 
 
 		 381 aa  186  6e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.54 
 
 		 356 aa  185  8e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  35.8 
 
 		 368 aa  182  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 		 355 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  34.75 
 
 		 354 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 355 aa  179  8e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  34.38 
 
 		 355 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  36.18 
 
 		 361 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  32.76 
 
 		 358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 355 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  35.36 
 
 		 364 aa  172  9e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 		 361 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  33.03 
 
 		 357 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.1 
 
 		 357 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 361 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.73 
 
 		 357 aa  167  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 369 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 383 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  31.98 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  33.14 
 
 		 369 aa  166  8e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.22 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2653  RND family efflux transporter MFP subunit  36.97 
 
 		 391 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.399935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.49 
 
 		 383 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  33.71 
 
 		 357 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 369 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 369 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 		 361 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 387 aa  159  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  37.04 
 
 		 375 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  32.17 
 
 		 396 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  34.2 
 
 		 394 aa  157  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 418 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  32.37 
 
 		 368 aa  155  8e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  33.11 
 
 		 366 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 		 379 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.03 
 
 		 361 aa  153  5e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  31.98 
 
 		 392 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 		 370 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  32.29 
 
 		 374 aa  150  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.7 
 
 		 367 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 		 417 aa  150  4e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  30.03 
 
 		 367 aa  150  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 371 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  32.14 
 
 		 368 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  32.37 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 366 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  34.39 
 
 		 369 aa  145  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.89 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  32.58 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  31.23 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.04 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 366 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.63 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 396 aa  142  9e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 371 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>