More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1968 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  100 
 
 		 394 aa  788    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  95.3 
 
 		 383 aa  657    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  70.05 
 
 		 369 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  69.51 
 
 		 361 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  69.42 
 
 		 396 aa  503  1e-141  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  69.15 
 
 		 369 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  69.15 
 
 		 369 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  78.47 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  68.87 
 
 		 369 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  68.6 
 
 		 403 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  67.66 
 
 		 371 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  67.58 
 
 		 370 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  68.32 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  68.32 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  68.32 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  59.45 
 
 		 392 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  59.53 
 
 		 377 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  40.61 
 
 		 370 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 377 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 		 418 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  36.64 
 
 		 369 aa  195  9e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  38.05 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  35 
 
 		 367 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.62 
 
 		 367 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  39.42 
 
 		 359 aa  189  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.86 
 
 		 402 aa  186  7e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 367 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 360 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  37.32 
 
 		 402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  36.78 
 
 		 365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 368 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.68 
 
 		 402 aa  182  7e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  34.99 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  37.05 
 
 		 363 aa  179  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.49 
 
 		 356 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  37.32 
 
 		 367 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  32.97 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  38.14 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.67 
 
 		 368 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.21 
 
 		 379 aa  176  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  39.04 
 
 		 372 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  34.08 
 
 		 374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  35.12 
 
 		 363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  37.86 
 
 		 361 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.03 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.28 
 
 		 357 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  36.93 
 
 		 396 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  35.28 
 
 		 368 aa  171  3e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.7 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 366 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 367 aa  170  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  35.38 
 
 		 405 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  38.01 
 
 		 362 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  36.14 
 
 		 390 aa  168  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.96 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  33.9 
 
 		 357 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 		 372 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 368 aa  166  8e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.16 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 354 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  35.24 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  33.24 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.17 
 
 		 357 aa  164  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.03 
 
 		 379 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  33.62 
 
 		 361 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  32.88 
 
 		 523 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 369 aa  162  7e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.02 
 
 		 357 aa  162  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  34.71 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  39.12 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.66 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  33.91 
 
 		 364 aa  161  2e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  32.58 
 
 		 358 aa  160  5e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.5 
 
 		 367 aa  159  6e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 364 aa  159  7e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  35.07 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.78 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.7 
 
 		 371 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.03 
 
 		 361 aa  157  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 357 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  36.25 
 
 		 383 aa  157  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.99 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.78 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  34.6 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.68 
 
 		 395 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  36.52 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  31.74 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  35.35 
 
 		 360 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5368  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.43 
 
 		 362 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0514804  normal  0.515508 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 395 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 417 aa  152  8e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1424  RND family mulitdrug efflux protein  33.52 
 
 		 358 aa  152  8e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.451308  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>