More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3351 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 367 aa  728    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  72.21 
 
 		 366 aa  531  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  72.55 
 
 		 367 aa  508  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  71.66 
 
 		 367 aa  498  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  71.39 
 
 		 366 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  71.12 
 
 		 366 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  71.12 
 
 		 366 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  73.27 
 
 		 366 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.52 
 
 		 379 aa  282  7.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.99 
 
 		 379 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  39.67 
 
 		 362 aa  206  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 418 aa  205  9e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  38.31 
 
 		 390 aa  203  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  38.75 
 
 		 370 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  39.23 
 
 		 359 aa  199  5e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 523 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.37 
 
 		 370 aa  195  9e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  36.51 
 
 		 368 aa  192  6e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  37.13 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  38.04 
 
 		 363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 		 361 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  34.67 
 
 		 396 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  34.44 
 
 		 363 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 369 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 		 361 aa  181  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 402 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.96 
 
 		 402 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  38.08 
 
 		 378 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 369 aa  176  6e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.95 
 
 		 368 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.36 
 
 		 369 aa  175  9e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  36.06 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 375 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.32 
 
 		 383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 403 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 		 395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  36.83 
 
 		 367 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.28 
 
 		 356 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  35.11 
 
 		 362 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  32 
 
 		 358 aa  172  6.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  38.26 
 
 		 368 aa  172  7.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  33.89 
 
 		 367 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.83 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  36.5 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 383 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 357 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  36.69 
 
 		 363 aa  169  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.75 
 
 		 366 aa  169  5e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 371 aa  169  7e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  33.33 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  38.3 
 
 		 367 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1968  multidrug efflux pump, membrane fusion protein CzcB subfamily  33.24 
 
 		 394 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0347448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 362 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  33.02 
 
 		 372 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1099  RND family efflux transporter MFP subunit  37.05 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 		 356 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 372 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.61 
 
 		 360 aa  166  4e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 367 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  36.44 
 
 		 367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0736  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 361 aa  166  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  30.79 
 
 		 357 aa  166  9e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  35.54 
 
 		 394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  36.92 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.5 
 
 		 417 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 357 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.76 
 
 		 367 aa  164  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 365 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  35.78 
 
 		 374 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1265  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 		 396 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 369 aa  162  8.000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  36.5 
 
 		 385 aa  161  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  35.74 
 
 		 362 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.83 
 
 		 369 aa  161  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  34.63 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5235  RND family efflux transporter MFP subunit  35.74 
 
 		 362 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  34.71 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  34.74 
 
 		 360 aa  159  5e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  35.98 
 
 		 368 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  33.05 
 
 		 368 aa  159  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  32.95 
 
 		 374 aa  159  9e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4341  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 394 aa  159  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.61 
 
 		 398 aa  158  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4710  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 383 aa  159  1e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>