More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3773 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 384 aa  768    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.6 
 
 		 379 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.33 
 
 		 379 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 		 367 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  37.79 
 
 		 367 aa  207  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  37.61 
 
 		 390 aa  205  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.59 
 
 		 367 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  37.68 
 
 		 523 aa  203  3e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  34.88 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  36.42 
 
 		 405 aa  195  9e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 370 aa  191  2e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  38.04 
 
 		 416 aa  189  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  37.4 
 
 		 398 aa  189  7e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  36.51 
 
 		 387 aa  189  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.62 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 		 402 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  36.83 
 
 		 402 aa  186  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.26 
 
 		 402 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 385 aa  185  9e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  36.74 
 
 		 366 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.74 
 
 		 366 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.54 
 
 		 397 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  37.05 
 
 		 366 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 374 aa  182  1e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  37.66 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 363 aa  178  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  35.11 
 
 		 368 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  39.08 
 
 		 374 aa  178  2e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.14 
 
 		 379 aa  177  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  37.85 
 
 		 396 aa  176  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.99 
 
 		 359 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  36.57 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  37.64 
 
 		 361 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.81 
 
 		 368 aa  169  6e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.23 
 
 		 360 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 361 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  35.31 
 
 		 368 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  34.62 
 
 		 365 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  39.32 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.16 
 
 		 361 aa  162  7e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 		 361 aa  162  8.000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.58 
 
 		 367 aa  161  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 361 aa  161  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.78 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  32.76 
 
 		 367 aa  159  9e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 368 aa  159  9e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  34.07 
 
 		 378 aa  157  2e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.89 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 357 aa  157  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  33.05 
 
 		 355 aa  156  4e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  32.63 
 
 		 372 aa  156  6e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  35.28 
 
 		 360 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  32.63 
 
 		 372 aa  155  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 354 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 		 357 aa  155  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 403 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.52 
 
 		 356 aa  155  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  32.64 
 
 		 355 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.26 
 
 		 370 aa  153  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.76 
 
 		 372 aa  153  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 369 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.95 
 
 		 369 aa  152  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  33.05 
 
 		 355 aa  152  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  32.87 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1311  HlyD family secretion protein  31.52 
 
 		 357 aa  150  3e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 370 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  30.08 
 
 		 354 aa  150  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.86 
 
 		 361 aa  150  5e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 		 371 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.81 
 
 		 365 aa  150  5e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5175  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.68 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  31.28 
 
 		 364 aa  149  6e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  32.13 
 
 		 371 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  32.16 
 
 		 363 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 369 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  32.49 
 
 		 355 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.6 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  32.01 
 
 		 358 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  32.15 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 369 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.92 
 
 		 357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  30.88 
 
 		 350 aa  146  5e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3506  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 364 aa  146  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.57 
 
 		 370 aa  145  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 377 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.47 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 357 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.7 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.69 
 
 		 395 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  32.44 
 
 		 375 aa  143  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  34 
 
 		 357 aa  143  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>