More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4375 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 369 aa  701    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  82.95 
 
 		 365 aa  524  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  59.77 
 
 		 365 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  58.62 
 
 		 368 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  56.32 
 
 		 374 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  53.91 
 
 		 394 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.97 
 
 		 368 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  57.93 
 
 		 368 aa  347  2e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.99 
 
 		 371 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  56.53 
 
 		 368 aa  336  5e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  53.12 
 
 		 367 aa  325  7e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  50.43 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  43.65 
 
 		 405 aa  212  9e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  41.36 
 
 		 363 aa  209  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  43.61 
 
 		 368 aa  209  7e-53  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 523 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.52 
 
 		 361 aa  204  3e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.08 
 
 		 361 aa  202  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  40.91 
 
 		 375 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.23 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  44.92 
 
 		 361 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  42.72 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.33 
 
 		 402 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.92 
 
 		 402 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  40.54 
 
 		 402 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.29 
 
 		 371 aa  192  6e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  42.68 
 
 		 369 aa  192  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.44 
 
 		 369 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  44.03 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  44.03 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  41.43 
 
 		 369 aa  190  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  44.04 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  42.11 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  43.37 
 
 		 369 aa  186  6e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  40.19 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.5 
 
 		 370 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  40.78 
 
 		 367 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.78 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.73 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  41.99 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  43.04 
 
 		 369 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  40.92 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  40.52 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  37.09 
 
 		 369 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.07 
 
 		 370 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 369 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  36.13 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  37.16 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  36.69 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.69 
 
 		 369 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  41.32 
 
 		 370 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  41.53 
 
 		 367 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  35.16 
 
 		 372 aa  175  9e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  35.16 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  40.38 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  38.83 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  35.83 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  39.08 
 
 		 364 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  40.58 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  38.66 
 
 		 367 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  42.39 
 
 		 378 aa  172  9e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.54 
 
 		 356 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  40.26 
 
 		 371 aa  171  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  37.07 
 
 		 357 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  40.74 
 
 		 363 aa  171  3e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  34.84 
 
 		 384 aa  169  7e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  38.34 
 
 		 367 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.64 
 
 		 357 aa  166  5e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 403 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  39.09 
 
 		 348 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 371 aa  166  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  37.22 
 
 		 356 aa  166  8e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.91 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  38.53 
 
 		 395 aa  164  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  36.01 
 
 		 390 aa  164  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 418 aa  164  3e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.33 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 		 360 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  38.55 
 
 		 357 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 371 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  34.57 
 
 		 374 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 		 392 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  37.38 
 
 		 416 aa  161  2e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  38.82 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  35.97 
 
 		 370 aa  160  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 384 aa  159  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.71 
 
 		 357 aa  159  8e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.49 
 
 		 417 aa  159  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.96 
 
 		 366 aa  157  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 367 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 372 aa  156  7e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 372 aa  155  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 		 366 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  33.89 
 
 		 358 aa  155  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.37 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  37.75 
 
 		 360 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>