More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4122 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 361 aa  718    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  98.61 
 
 		 361 aa  707    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  80.34 
 
 		 363 aa  538  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.12 
 
 		 361 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  48.45 
 
 		 369 aa  267  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.85 
 
 		 369 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  50.43 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  47.38 
 
 		 369 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  46.13 
 
 		 371 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  47.06 
 
 		 369 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.77 
 
 		 371 aa  259  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.27 
 
 		 369 aa  258  1e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  49.41 
 
 		 371 aa  256  5e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  48.99 
 
 		 375 aa  256  5e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  48.22 
 
 		 367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.53 
 
 		 366 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  47.93 
 
 		 367 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  45.27 
 
 		 367 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  47.37 
 
 		 371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.94 
 
 		 370 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  45.01 
 
 		 368 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  45.11 
 
 		 369 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  46.67 
 
 		 369 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  47.42 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  47.42 
 
 		 374 aa  226  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  46.39 
 
 		 369 aa  226  6e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.33 
 
 		 371 aa  225  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.96 
 
 		 371 aa  223  4e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  46.63 
 
 		 371 aa  222  8e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  46.81 
 
 		 374 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  44.2 
 
 		 395 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  40.34 
 
 		 368 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.88 
 
 		 368 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  43.18 
 
 		 405 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.72 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  38.2 
 
 		 394 aa  195  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  44.95 
 
 		 365 aa  195  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  39.47 
 
 		 365 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  37.68 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  40.4 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  38.94 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  38.01 
 
 		 366 aa  189  9e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  40.34 
 
 		 390 aa  187  2e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  37.57 
 
 		 367 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  39.2 
 
 		 378 aa  186  4e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  38.11 
 
 		 368 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.77 
 
 		 371 aa  183  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.94 
 
 		 402 aa  182  6e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.94 
 
 		 402 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  40.72 
 
 		 368 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  39.26 
 
 		 402 aa  179  8e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  37.54 
 
 		 374 aa  178  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  38.02 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  40.51 
 
 		 416 aa  177  4e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  37.5 
 
 		 367 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.01 
 
 		 417 aa  176  5e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  42.57 
 
 		 385 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  37.19 
 
 		 367 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.91 
 
 		 379 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 350 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.81 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  41.21 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 366 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.88 
 
 		 366 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 366 aa  164  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  39.15 
 
 		 387 aa  160  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  37.94 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  36.59 
 
 		 374 aa  159  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.28 
 
 		 356 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.91 
 
 		 361 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.25 
 
 		 397 aa  155  9e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  33.62 
 
 		 369 aa  153  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  35.45 
 
 		 356 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3466  AbgT putative transporter  36.44 
 
 		 361 aa  152  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.081468 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.72 
 
 		 370 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 359 aa  151  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  34.5 
 
 		 368 aa  150  3e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  34.39 
 
 		 370 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.34 
 
 		 379 aa  149  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 369 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  32.16 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4927  RND family efflux transporter MFP subunit  36.92 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.72338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0735  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.2 
 
 		 357 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  33.71 
 
 		 358 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 384 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 363 aa  142  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  31.94 
 
 		 372 aa  143  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  31.94 
 
 		 372 aa  142  7e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.68 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2292  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 383 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.516168  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>