More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0940 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  100 
 
 		 368 aa  727    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  67.21 
 
 		 369 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.14 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  68.35 
 
 		 375 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  64.71 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  65.19 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  64.21 
 
 		 371 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.45 
 
 		 371 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  63.41 
 
 		 369 aa  407  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  62.06 
 
 		 369 aa  403  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  63.69 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  62.78 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  64.69 
 
 		 371 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  62.8 
 
 		 367 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  61.71 
 
 		 371 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  61.52 
 
 		 371 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.76 
 
 		 371 aa  386  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  65.68 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  65.68 
 
 		 374 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  64.5 
 
 		 374 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  64.67 
 
 		 369 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  63.04 
 
 		 369 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  57.02 
 
 		 348 aa  332  7.000000000000001e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.77 
 
 		 366 aa  301  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  56.27 
 
 		 395 aa  295  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.99 
 
 		 370 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  51.78 
 
 		 371 aa  281  1e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.76 
 
 		 361 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  45.93 
 
 		 363 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  45.01 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.01 
 
 		 361 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.61 
 
 		 369 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  42.63 
 
 		 365 aa  199  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  36.86 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  39.17 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.87 
 
 		 368 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 368 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  37.43 
 
 		 365 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  38.26 
 
 		 367 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.19 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  37.1 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  36.84 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 374 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  37.42 
 
 		 523 aa  176  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.11 
 
 		 366 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.14 
 
 		 367 aa  172  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 		 366 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  36.16 
 
 		 368 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  35.67 
 
 		 367 aa  170  4e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 366 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 		 366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  39.31 
 
 		 366 aa  163  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 350 aa  162  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 362 aa  154  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  34.39 
 
 		 402 aa  152  8e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.35 
 
 		 379 aa  151  1e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.58 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.39 
 
 		 370 aa  151  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 402 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.89 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.02 
 
 		 367 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.11 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  34.31 
 
 		 383 aa  146  5e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5193  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.01 
 
 		 372 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  36 
 
 		 359 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  37.69 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  36.12 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.66 
 
 		 417 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 374 aa  143  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  33.61 
 
 		 378 aa  143  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 383 aa  142  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 363 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  32.01 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  35.31 
 
 		 367 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  32.95 
 
 		 356 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 384 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  32.01 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.87 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  37.7 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  32.29 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  35.12 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 369 aa  137  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  36.64 
 
 		 398 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  31.44 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 369 aa  135  8e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  35.44 
 
 		 387 aa  135  9e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1423  RND family mulitdrug efflux protein  31.4 
 
 		 371 aa  135  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.427177  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  31.91 
 
 		 370 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.12 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.42 
 
 		 379 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  32.68 
 
 		 364 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  34.5 
 
 		 390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 369 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  34.21 
 
 		 361 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  30.55 
 
 		 403 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.58 
 
 		 366 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>