More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6578 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 369 aa  710    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  97.02 
 
 		 369 aa  600  1e-170  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  88.5 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  88.5 
 
 		 374 aa  543  1e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  86.4 
 
 		 374 aa  527  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  83.83 
 
 		 371 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.09 
 
 		 371 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  72.24 
 
 		 369 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  73.78 
 
 		 371 aa  474  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  67.47 
 
 		 371 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.62 
 
 		 371 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  72.8 
 
 		 371 aa  456  1e-127  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  69.27 
 
 		 369 aa  454  1e-127  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  69.54 
 
 		 375 aa  453  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.23 
 
 		 369 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  67.87 
 
 		 369 aa  417  9.999999999999999e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  62.43 
 
 		 368 aa  413  1e-114  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  64.97 
 
 		 369 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  65.15 
 
 		 369 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  66.57 
 
 		 367 aa  395  1e-109  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  64.27 
 
 		 367 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  65.22 
 
 		 367 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  62.64 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  63.23 
 
 		 395 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.37 
 
 		 366 aa  323  2e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  55.32 
 
 		 371 aa  305  7e-82  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.1 
 
 		 370 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.24 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  49.15 
 
 		 363 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  46.53 
 
 		 361 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.55 
 
 		 361 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  37.5 
 
 		 368 aa  209  6e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  37.6 
 
 		 368 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 365 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.43 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  39.4 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  38.19 
 
 		 374 aa  192  6e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 396 aa  189  9e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 		 371 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4902  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.87 
 
 		 368 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  37.29 
 
 		 394 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  39.1 
 
 		 368 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  37.2 
 
 		 523 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  37.95 
 
 		 366 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  37.26 
 
 		 367 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 367 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  35.41 
 
 		 367 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  38.41 
 
 		 405 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  36.04 
 
 		 367 aa  162  9e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.07 
 
 		 402 aa  162  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  39.6 
 
 		 398 aa  161  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.78 
 
 		 402 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 362 aa  159  7e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  38.41 
 
 		 366 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.39 
 
 		 379 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.11 
 
 		 370 aa  155  9e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  36.28 
 
 		 402 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2547  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  31.44 
 
 		 350 aa  153  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  35.11 
 
 		 390 aa  152  5.9999999999999996e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.65 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  35.41 
 
 		 378 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  38.79 
 
 		 359 aa  150  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2574  RND family efflux transporter MFP subunit  38.22 
 
 		 416 aa  149  6e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205378 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5087  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.24 
 
 		 357 aa  149  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156095  normal  0.0832308 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4709  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.94 
 
 		 383 aa  149  9e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  31.41 
 
 		 384 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.86 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.17 
 
 		 360 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 366 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 364 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4857  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.64 
 
 		 384 aa  146  5e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  0.491578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.62 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.05 
 
 		 383 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.46 
 
 		 366 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2960  RND family efflux transporter MFP subunit  37.12 
 
 		 387 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.147665  hitchhiker  0.0025793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 366 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1206  RND family efflux transporter MFP subunit  39.03 
 
 		 385 aa  145  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.427148 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  33.82 
 
 		 368 aa  143  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.24 
 
 		 367 aa  143  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0344  secretion protein HlyD  34.59 
 
 		 372 aa  142  8e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.525441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1452  RND family efflux transporter MFP subunit  34.17 
 
 		 369 aa  142  9.999999999999999e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0187105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1100  RND family efflux transporter MFP subunit  38.56 
 
 		 361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.204612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2041  RND family mulitdrug efflux protein  32.41 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527576 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0230  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 367 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4340  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 387 aa  140  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.625227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.15 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 371 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 386 aa  139  8.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.97 
 
 		 357 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0173163  normal  0.372844 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.78 
 
 		 379 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5088  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 361 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.857117  normal  0.0828727 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0287  RND family efflux transporter MFP subunit  35.45 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44923  normal  0.678954 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.08 
 
 		 362 aa  136  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3130  secretion protein HlyD  33.98 
 
 		 395 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5082  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 362 aa  135  8e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.117888  normal  0.241341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>