More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0591 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 
350 aa  697    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0429  secretion protein HlyD  88.21 
 
 
213 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.398543  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 
361 aa  169  9e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.72 
 
 
361 aa  168  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 
361 aa  168  1e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  37.32 
 
 
363 aa  161  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  32.85 
 
 
375 aa  153  4e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  32.48 
 
 
368 aa  152  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  33.24 
 
 
371 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.9 
 
 
371 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 
369 aa  146  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 
374 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  32.28 
 
 
369 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  33.82 
 
 
374 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 
384 aa  143  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  33.53 
 
 
374 aa  143  4e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  31.64 
 
 
369 aa  143  5e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  33.72 
 
 
396 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  31.73 
 
 
523 aa  142  8e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 
367 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  31.29 
 
 
369 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  32.67 
 
 
345 aa  139  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.81 
 
 
366 aa  139  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.08 
 
 
394 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  31.27 
 
 
367 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.28 
 
 
379 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.01 
 
 
371 aa  134  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  30.88 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 
379 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1873  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 
369 aa  133  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.540389  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3206  transport lipoprotein  31.2 
 
 
371 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0443249  normal  0.0512525 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  32.16 
 
 
405 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  35.58 
 
 
359 aa  132  6.999999999999999e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.27 
 
 
369 aa  132  7.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 
370 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  31.27 
 
 
368 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  30.9 
 
 
366 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.25 
 
 
370 aa  129  7.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  33.33 
 
 
365 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3320  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 
371 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.591091  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.23 
 
 
356 aa  126  6e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.55 
 
 
369 aa  125  8.000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.22 
 
 
366 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  31.34 
 
 
369 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  30.55 
 
 
367 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  29.33 
 
 
371 aa  122  9e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5105  RND family efflux transporter MFP subunit  31.18 
 
 
348 aa  121  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  30.85 
 
 
367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  30.42 
 
 
362 aa  119  6e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.56 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  28.33 
 
 
418 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.12 
 
 
360 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4222  secretion protein HlyD  33.43 
 
 
368 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.163749 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8533  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 
370 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  30.14 
 
 
363 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  29.1 
 
 
396 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 
377 aa  117  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.44 
 
 
367 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 
370 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 
379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 
364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5654  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 
395 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0114559  normal  0.0122606 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  30.37 
 
 
357 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  31.27 
 
 
367 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.46 
 
 
402 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2562  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 
371 aa  114  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.032186  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.92 
 
 
397 aa  113  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4074  secretion protein HlyD  31.27 
 
 
368 aa  113  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  32.04 
 
 
374 aa  113  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  33.83 
 
 
361 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.09 
 
 
361 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  32.04 
 
 
363 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1081  secretion protein HlyD  31.18 
 
 
374 aa  112  8.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.157732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  31.25 
 
 
356 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  26.11 
 
 
354 aa  112  9e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 
369 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.18 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  31.02 
 
 
355 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.68 
 
 
383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.97 
 
 
369 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 
369 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1752  RND family efflux transporter MFP subunit  28.53 
 
 
369 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 
362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.36 
 
 
367 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1392  RND family efflux transporter MFP subunit  29.61 
 
 
369 aa  108  1e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484541  normal  0.684664 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.97 
 
 
402 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 
403 aa  108  1e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  29.46 
 
 
368 aa  107  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4375  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.44 
 
 
369 aa  106  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  27.95 
 
 
358 aa  106  5e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  29.13 
 
 
398 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.01 
 
 
381 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  32 
 
 
366 aa  105  8e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2752  RND family efflux transporter MFP subunit  34.42 
 
 
365 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239628  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  29.59 
 
 
363 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.18 
 
 
357 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  31.54 
 
 
363 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  30.19 
 
 
378 aa  104  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  30.14 
 
 
355 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  28.25 
 
 
390 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>