More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0429 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0429  secretion protein HlyD  100 
 
 		 213 aa  426  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.398543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0591  RND family efflux transporter MFP subunit  88.21 
 
 		 350 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.13 
 
 		 379 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.38 
 
 		 361 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.2 
 
 		 379 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3773  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 384 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.265534  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3799  RND family efflux transporter MFP subunit  33.49 
 
 		 361 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4122  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.49 
 
 		 361 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6002  RND family efflux transporter MFP subunit  38.18 
 
 		 363 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249457  normal  0.124375 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5192  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 356 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3130  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 377 aa  95.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.645496  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1704  secretion protein HlyD  35.26 
 
 		 345 aa  95.1  8e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000161104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0821  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.91 
 
 		 371 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3223  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.89 
 
 		 381 aa  93.6  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3301  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.1 
 
 		 366 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.168698  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  34.83 
 
 		 367 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0940  component of multidrug efflux system  32.02 
 
 		 368 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  32.85 
 
 		 418 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2532  secretion protein HlyD  38.2 
 
 		 359 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.19676  normal  0.860631 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 		 370 aa  90.1  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2690  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.36 
 
 		 360 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  33.49 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  34.71 
 
 		 367 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46580  putative multidrug efflux gene product  34.22 
 
 		 371 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561033  hitchhiker  0.00000166961 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1289  putative transport/efflux transmembrane protein  35.42 
 
 		 378 aa  89.7  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.173538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5174  RND efflux transporter  33.33 
 
 		 355 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.274772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  33.49 
 
 		 523 aa  89  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5081  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 355 aa  88.2  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.167851  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2814  RND family efflux transporter MFP subunit  32.35 
 
 		 370 aa  87.4  1e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0827  RND family efflux transporter MFP subunit  39.77 
 
 		 374 aa  87.8  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.308781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  32.47 
 
 		 366 aa  87  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6292  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 369 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.585328  hitchhiker  0.00894017 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6578  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 369 aa  87.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.845685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5640  secretion protein HlyD  30.96 
 
 		 375 aa  86.3  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0999  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.86 
 
 		 366 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5234  RND family efflux transporter MFP subunit  32.32 
 
 		 355 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1298  secretion protein HlyD  34.05 
 
 		 374 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.394122  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6532  RND family efflux transporter MFP subunit  34.05 
 
 		 374 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  33.33 
 
 		 356 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  32.11 
 
 		 362 aa  85.5  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 		 366 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5211  HlyD family secretion protein  29.9 
 
 		 358 aa  85.9  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2532  secretion protein HlyD  38.36 
 
 		 363 aa  85.5  6e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6139  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 374 aa  85.5  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.762329 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0345  secretion protein HlyD  37.08 
 
 		 361 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.336549 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  31 
 
 		 358 aa  85.1  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  34.46 
 
 		 355 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.527133 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.85 
 
 		 379 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2797  secretion protein HlyD  33.67 
 
 		 367 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.798419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2826  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0174041 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.8 
 
 		 371 aa  83.6  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0864007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2484  secretion protein HlyD  32.49 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00634188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3506  RND family efflux transporter MFP subunit  30.5 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1356  secretion protein HlyD  34.87 
 
 		 365 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.925373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1555  secretion protein HlyD  34.76 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2037  secretion protein HlyD  34.31 
 
 		 363 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3131  secretion protein HlyD  32.08 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.735534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01960  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  33.84 
 
 		 356 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.496395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  29.76 
 
 		 407 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3301  RND efflux membrane fusion protein  33.82 
 
 		 367 aa  82.4  0.000000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.176588 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2424  RND family efflux transporter MFP subunit  33.82 
 
 		 367 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.295502  normal  0.460452 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.84 
 
 		 371 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0056  secretion protein HlyD  28.64 
 
 		 354 aa  82  0.000000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3411  secretion protein HlyD  31.75 
 
 		 363 aa  82  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.591463  normal  0.695679 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  33 
 
 		 390 aa  82  0.000000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  32.64 
 
 		 368 aa  82  0.000000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3445  secretion protein HlyD  32.09 
 
 		 369 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.153008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 436 aa  81.3  0.000000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0915  secretion protein, putative  33.99 
 
 		 368 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4314  RND family efflux transporter MFP subunit  30.43 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00180968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.32 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.923896  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  80.5  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.331949  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2193  secretion protein HlyD  31.38 
 
 		 367 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00691004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1372  secretion protein HlyD  32.32 
 
 		 405 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203736  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2781  RND family efflux transporter MFP subunit  35.05 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0809  hypothetical protein  34.18 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.244326 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1325  RND family efflux transporter MFP subunit  30.33 
 
 		 370 aa  79  0.00000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.784041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3214  putative efflux protein  31.79 
 
 		 367 aa  78.6  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  34.32 
 
 		 372 aa  77.8  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0231  secretion protein HlyD  33.55 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  34.32 
 
 		 372 aa  77.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.38 
 
 		 367 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  37.65 
 
 		 366 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3547  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 371 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  32.34 
 
 		 364 aa  76.6  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.57 
 
 		 395 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.85 
 
 		 361 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  30.65 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000228  membrane-fusion protein  28.57 
 
 		 357 aa  77  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1551  secretion protein HlyD  34.67 
 
 		 398 aa  77  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  30.18 
 
 		 379 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  30.15 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.15 
 
 		 383 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.17 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  30.15 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 366 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2778  RND family efflux transporter MFP subunit  31.58 
 
 		 359 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.223876 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3140  RND family efflux transporter MFP subunit  33.67 
 
 		 369 aa  75.5  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>