More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2639 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 436 aa  879    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  42.22 
 
 		 393 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  43.17 
 
 		 389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  41.82 
 
 		 387 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.53 
 
 		 398 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  39.09 
 
 		 435 aa  272  7e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.57 
 
 		 414 aa  269  8e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  40.56 
 
 		 430 aa  268  1e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  38.59 
 
 		 371 aa  266  7e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.32 
 
 		 404 aa  262  8e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  35.51 
 
 		 406 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.79 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.96 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  39.39 
 
 		 412 aa  246  4.9999999999999997e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.16 
 
 		 414 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 371 aa  244  3e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  38.98 
 
 		 392 aa  239  8e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 392 aa  233  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  37.1 
 
 		 377 aa  232  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.56 
 
 		 377 aa  230  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  37.71 
 
 		 384 aa  230  3e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.04 
 
 		 391 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 430 aa  226  7e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 412 aa  225  9e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 412 aa  226  9e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  37.29 
 
 		 385 aa  225  1e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  33.59 
 
 		 418 aa  225  1e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  34.6 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  38.21 
 
 		 400 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  34.88 
 
 		 476 aa  224  3e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  34.6 
 
 		 412 aa  223  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  36.23 
 
 		 384 aa  223  7e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 		 412 aa  223  7e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 412 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  34.33 
 
 		 412 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  35.94 
 
 		 384 aa  222  9.999999999999999e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.28 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.33 
 
 		 412 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.05 
 
 		 396 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  35.58 
 
 		 393 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  34.66 
 
 		 415 aa  220  3e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  37.2 
 
 		 396 aa  219  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  36.06 
 
 		 396 aa  218  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  33.62 
 
 		 382 aa  218  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  35.81 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 404 aa  216  7e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.61 
 
 		 416 aa  215  9.999999999999999e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  36.01 
 
 		 412 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.63 
 
 		 381 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  35.59 
 
 		 365 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.53 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  35.92 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.92 
 
 		 381 aa  211  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 413 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  39.13 
 
 		 414 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  33.78 
 
 		 368 aa  211  3e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.54 
 
 		 408 aa  210  3e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 413 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.38 
 
 		 388 aa  209  9e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.1 
 
 		 427 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  33.15 
 
 		 391 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  35.54 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.77 
 
 		 414 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  35.01 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.07 
 
 		 368 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  34.44 
 
 		 401 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 392 aa  207  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.66 
 
 		 414 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  36.29 
 
 		 414 aa  206  5e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  37.97 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  37.97 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 405 aa  206  8e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  34.89 
 
 		 417 aa  206  9e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  36.29 
 
 		 398 aa  205  1e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  37.07 
 
 		 413 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1349  RND family efflux transporter MFP subunit  36.74 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0306533 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  37.19 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  34.29 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  35.06 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  35.06 
 
 		 429 aa  203  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  35.71 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  33.83 
 
 		 428 aa  202  7e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  35.96 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 405 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35.19 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  35.71 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.31 
 
 		 409 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  34.77 
 
 		 399 aa  200  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 		 424 aa  199  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.8 
 
 		 420 aa  199  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  35.93 
 
 		 408 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  31.55 
 
 		 408 aa  199  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  35.61 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  37.35 
 
 		 408 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>