More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1088 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 392 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  49.3 
 
 		 417 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  46.33 
 
 		 414 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  47.27 
 
 		 413 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  47.68 
 
 		 413 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  48.5 
 
 		 413 aa  325  6e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  47.14 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.14 
 
 		 413 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  46.9 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33860  multidrug efflux RND membrane protein, HlyD family  48.6 
 
 		 412 aa  318  7.999999999999999e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  46.9 
 
 		 414 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  46.9 
 
 		 414 aa  316  5e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  46.37 
 
 		 414 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  43.12 
 
 		 410 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  44.33 
 
 		 411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.7 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4335  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.7 
 
 		 436 aa  304  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.514202  normal  0.256174 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  45.48 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  44.82 
 
 		 387 aa  298  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.4 
 
 		 416 aa  295  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  46.92 
 
 		 388 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  44.69 
 
 		 408 aa  288  8e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  41.48 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  45.63 
 
 		 405 aa  287  2e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.34 
 
 		 424 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  45.35 
 
 		 405 aa  285  7e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.77 
 
 		 408 aa  285  8e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  44.63 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  45.07 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  45.07 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  45.07 
 
 		 405 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  44.54 
 
 		 418 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  43.4 
 
 		 405 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  47.23 
 
 		 418 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  41.25 
 
 		 428 aa  282  8.000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  43.84 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  43.84 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  43.84 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  43.84 
 
 		 406 aa  280  4e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  43.84 
 
 		 409 aa  280  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  43.13 
 
 		 391 aa  280  4e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  43.93 
 
 		 412 aa  280  4e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.91 
 
 		 419 aa  279  5e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  43.84 
 
 		 409 aa  279  6e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  41.26 
 
 		 371 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3373  RND family efflux transporter MFP subunit  45.35 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  42.28 
 
 		 404 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4634  RND family efflux transporter MFP subunit  42.98 
 
 		 429 aa  268  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.562661  normal  0.24851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  42.67 
 
 		 415 aa  267  2e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  41.4 
 
 		 412 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  39.69 
 
 		 412 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1902  secretion protein HlyD  44.89 
 
 		 409 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.555792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  42.58 
 
 		 409 aa  264  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.58 
 
 		 399 aa  264  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  39.43 
 
 		 412 aa  264  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 		 412 aa  263  3e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  39.25 
 
 		 476 aa  263  3e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 		 412 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.07 
 
 		 412 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 396 aa  262  8e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  39.09 
 
 		 382 aa  262  8e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1619  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  43.85 
 
 		 386 aa  259  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  43.03 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3429  secretion protein HlyD  43.12 
 
 		 411 aa  259  6e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  41.02 
 
 		 396 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  42.41 
 
 		 413 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 		 414 aa  258  1e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.33 
 
 		 396 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.35 
 
 		 420 aa  257  3e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2891  RND efflux system membrane fusion protein  44.85 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.81851  normal  0.755183 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.51 
 
 		 396 aa  256  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  43.58 
 
 		 400 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 399 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  38.77 
 
 		 406 aa  254  3e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3985  RND family efflux transporter MFP subunit  42.05 
 
 		 410 aa  252  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  40.7 
 
 		 399 aa  252  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4358  RND family efflux transporter MFP subunit  42.33 
 
 		 421 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  41.64 
 
 		 429 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  45.65 
 
 		 402 aa  251  2e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  41.64 
 
 		 399 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  41.38 
 
 		 393 aa  249  4e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  42.86 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5121  RND family efflux transporter MFP subunit  43.81 
 
 		 396 aa  247  3e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0405  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.77 
 
 		 408 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.738714  hitchhiker  0.0000278759 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0445  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  42.77 
 
 		 408 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000283487 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  44.73 
 
 		 414 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0383  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.9 
 
 		 408 aa  246  6e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  39.84 
 
 		 371 aa  246  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0385  putative auxiliary transport protein, membrane fusion protein (MFP) family  42.77 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0391  putative auxiliary transport protein membrane fusion protein (MFP) family  42.45 
 
 		 408 aa  245  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000301381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.48 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  43.09 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  43.09 
 
 		 400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  39.55 
 
 		 393 aa  243  6e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.5 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  38.5 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  39.05 
 
 		 392 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>