More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1361 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  100 
 
 		 387 aa  785    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1665  secretion protein HlyD  51.27 
 
 		 398 aa  318  7e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.454837  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  44.38 
 
 		 435 aa  312  4.999999999999999e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.27 
 
 		 398 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  44.41 
 
 		 389 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  45.28 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.82 
 
 		 436 aa  295  6e-79  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4789  RND family efflux transporter MFP subunit  46.03 
 
 		 392 aa  294  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3513  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.86 
 
 		 398 aa  287  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.54 
 
 		 404 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0629  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.99 
 
 		 414 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00302597 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  40.76 
 
 		 384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  42.52 
 
 		 384 aa  282  8.000000000000001e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  43.13 
 
 		 393 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  37.89 
 
 		 412 aa  251  1e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  38.54 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.66 
 
 		 414 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  38.42 
 
 		 371 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  39.29 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0869  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 352 aa  225  9e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  39.39 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 392 aa  220  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.63 
 
 		 388 aa  218  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0761316  hitchhiker  0.00258561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  37.37 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  38.2 
 
 		 377 aa  217  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  36.78 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  38.65 
 
 		 414 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.4 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  39.51 
 
 		 381 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.08 
 
 		 399 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  35.16 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.62 
 
 		 392 aa  208  1e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 415 aa  208  1e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 385 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  34.2 
 
 		 396 aa  208  1e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 413 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  36.92 
 
 		 387 aa  207  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  34.69 
 
 		 371 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  36.04 
 
 		 413 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  36.04 
 
 		 413 aa  206  4e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1152  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.59 
 
 		 435 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00127856  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  36.65 
 
 		 382 aa  206  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  37.67 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 386 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 		 413 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 386 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  34.63 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  36.42 
 
 		 384 aa  202  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 408 aa  202  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  34.91 
 
 		 418 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.64 
 
 		 381 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  38.71 
 
 		 414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  38.25 
 
 		 411 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 353 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35.66 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  34.13 
 
 		 476 aa  200  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  37.33 
 
 		 412 aa  200  3e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5851  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.24 
 
 		 369 aa  200  3e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.834667 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  34.88 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 		 392 aa  200  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.08 
 
 		 408 aa  199  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 391 aa  199  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.31 
 
 		 430 aa  199  7e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  37.98 
 
 		 411 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 416 aa  199  7.999999999999999e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 412 aa  199  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  36.16 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  38.67 
 
 		 426 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 412 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  34.63 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  34.35 
 
 		 427 aa  198  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  34.51 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  35.73 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  35.73 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  35.73 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.67 
 
 		 368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  35.73 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  35.4 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  35.73 
 
 		 406 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  35.4 
 
 		 405 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  35.73 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 399 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.49 
 
 		 396 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  35.86 
 
 		 405 aa  196  7e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1891  RND family efflux transporter MFP subunit  35.62 
 
 		 391 aa  196  8.000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.497754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 		 424 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2129  hypothetical protein  34.68 
 
 		 368 aa  195  1e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  33.8 
 
 		 434 aa  195  1e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0163  RND family efflux transporter MFP subunit  39.02 
 
 		 404 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.49 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.18 
 
 		 381 aa  194  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0042  secretion protein HlyD  35.61 
 
 		 391 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 404 aa  194  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.91 
 
 		 416 aa  193  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>