More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1129 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  100 
 
 		 368 aa  736    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  42.39 
 
 		 411 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  42.12 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.73 
 
 		 373 aa  237  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  38.76 
 
 		 416 aa  235  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  40 
 
 		 403 aa  225  8e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  39.65 
 
 		 383 aa  225  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  37.94 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  37.64 
 
 		 373 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  36.09 
 
 		 387 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 		 391 aa  215  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  38.61 
 
 		 405 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 396 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  37.23 
 
 		 430 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  35.22 
 
 		 386 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 373 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 436 aa  207  3e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.29 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 379 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  36.2 
 
 		 396 aa  204  2e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  38.48 
 
 		 393 aa  202  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  38.08 
 
 		 393 aa  202  7e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 391 aa  202  9e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.23 
 
 		 392 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  35.69 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  36.84 
 
 		 398 aa  199  7.999999999999999e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  39.33 
 
 		 371 aa  199  9e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  34.42 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  36.36 
 
 		 422 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  37.93 
 
 		 369 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 405 aa  196  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  34.72 
 
 		 376 aa  196  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 386 aa  196  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  36.44 
 
 		 379 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 420 aa  195  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 386 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  35.22 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  36.29 
 
 		 427 aa  194  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.77 
 
 		 420 aa  194  2e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 		 425 aa  194  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  36.18 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  37 
 
 		 445 aa  193  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  37.67 
 
 		 381 aa  193  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 389 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 405 aa  193  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  37.02 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.73 
 
 		 560 aa  193  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  36.67 
 
 		 396 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.77 
 
 		 399 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1828  secretion protein HlyD  35.93 
 
 		 406 aa  192  1e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.8 
 
 		 436 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  34.32 
 
 		 428 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  34.96 
 
 		 404 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  38.29 
 
 		 383 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.54 
 
 		 422 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 407 aa  191  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  35.04 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 404 aa  191  2e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  36.49 
 
 		 425 aa  191  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 392 aa  191  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.93 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  34.12 
 
 		 390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  38.9 
 
 		 418 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.85 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  37.9 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  37.85 
 
 		 381 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  34.83 
 
 		 431 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  35.21 
 
 		 387 aa  189  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 445 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  34.05 
 
 		 371 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.22 
 
 		 384 aa  189  7e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  36.26 
 
 		 378 aa  189  9e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 396 aa  188  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 384 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  38.04 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  38.33 
 
 		 412 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  37.73 
 
 		 397 aa  188  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 385 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.05 
 
 		 396 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  35.31 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.43 
 
 		 410 aa  187  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 381 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 		 384 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 432 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.82 
 
 		 384 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  38.33 
 
 		 412 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.04 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  39.13 
 
 		 432 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 395 aa  186  6e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>