More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0410 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 407 aa  832    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  71.22 
 
 		 410 aa  549  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  55.98 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  55.68 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  54.21 
 
 		 428 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  55.29 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  55.29 
 
 		 445 aa  381  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.63 
 
 		 560 aa  375  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  53.45 
 
 		 412 aa  371  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.03 
 
 		 427 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  47.64 
 
 		 441 aa  360  2e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.55 
 
 		 401 aa  341  2e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.23 
 
 		 405 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  38.69 
 
 		 394 aa  269  5.9999999999999995e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  36.9 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  40.45 
 
 		 422 aa  246  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  36.65 
 
 		 383 aa  238  1e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  37.8 
 
 		 412 aa  238  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  37.73 
 
 		 400 aa  232  9e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  38.72 
 
 		 398 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 405 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.11 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.92 
 
 		 434 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  35.77 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.29 
 
 		 383 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 415 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.57 
 
 		 371 aa  219  6e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.88 
 
 		 396 aa  219  8.999999999999998e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.84 
 
 		 392 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.51 
 
 		 396 aa  217  2e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.1 
 
 		 412 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 403 aa  217  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  35.65 
 
 		 428 aa  216  5e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.44 
 
 		 410 aa  216  7e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  38.07 
 
 		 376 aa  215  9.999999999999999e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36 
 
 		 411 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  36.44 
 
 		 381 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39 
 
 		 469 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.05 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39 
 
 		 423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.11 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.23 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  36.8 
 
 		 408 aa  214  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  34.68 
 
 		 391 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  33.88 
 
 		 428 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  36.68 
 
 		 391 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  35.64 
 
 		 431 aa  212  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.48 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.83 
 
 		 393 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  35.81 
 
 		 428 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  37.36 
 
 		 430 aa  210  3e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.48 
 
 		 392 aa  210  4e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  37.18 
 
 		 397 aa  210  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.13 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  37.3 
 
 		 391 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  35.33 
 
 		 387 aa  209  5e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  36.67 
 
 		 397 aa  209  9e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  33.88 
 
 		 388 aa  208  1e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  34.61 
 
 		 397 aa  208  1e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  34.61 
 
 		 409 aa  208  1e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  35.67 
 
 		 394 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  33.88 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  34.61 
 
 		 409 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  34.35 
 
 		 409 aa  207  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 403 aa  207  3e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 420 aa  206  4e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.07 
 
 		 368 aa  205  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 430 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  37.39 
 
 		 415 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  32.56 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  35.31 
 
 		 400 aa  204  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 382 aa  204  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  35.96 
 
 		 396 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  34.58 
 
 		 378 aa  203  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  31.56 
 
 		 371 aa  202  7e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  35.73 
 
 		 386 aa  202  8e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  32.98 
 
 		 382 aa  202  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.2 
 
 		 436 aa  201  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  34.71 
 
 		 433 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  34.03 
 
 		 397 aa  201  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 382 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  34.22 
 
 		 400 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  35.97 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  33.53 
 
 		 386 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  35.97 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  35.97 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  31.87 
 
 		 383 aa  201  3e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 390 aa  200  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  35.97 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  35.97 
 
 		 420 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>