More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2894 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 397 aa  794    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  57.81 
 
 		 405 aa  427  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  54.55 
 
 		 392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.97 
 
 		 422 aa  392  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.43 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  51.17 
 
 		 382 aa  381  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  55.16 
 
 		 400 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  55.26 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  53.78 
 
 		 394 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.37 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  49.49 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  49.24 
 
 		 442 aa  364  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  52.45 
 
 		 381 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  52.53 
 
 		 383 aa  352  5.9999999999999994e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  49.1 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  48.91 
 
 		 395 aa  349  5e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.32 
 
 		 386 aa  348  1e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 423 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  48.37 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0103  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.93 
 
 		 382 aa  342  7e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  54.57 
 
 		 409 aa  342  1e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  50.53 
 
 		 395 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 384 aa  339  4e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.25 
 
 		 410 aa  339  4e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 384 aa  338  8e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  50.6 
 
 		 381 aa  338  9e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.79 
 
 		 393 aa  338  9.999999999999999e-92  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.83 
 
 		 395 aa  338  9.999999999999999e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  47.81 
 
 		 386 aa  337  1.9999999999999998e-91  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  47.81 
 
 		 386 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  52.75 
 
 		 412 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  47.35 
 
 		 381 aa  336  3.9999999999999995e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.51 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  47.51 
 
 		 381 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.69 
 
 		 411 aa  335  7.999999999999999e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  47.54 
 
 		 397 aa  334  1e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.04 
 
 		 403 aa  334  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  50.29 
 
 		 480 aa  334  2e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.66 
 
 		 405 aa  332  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  47.49 
 
 		 397 aa  332  7.000000000000001e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  46.83 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  46.83 
 
 		 395 aa  331  1e-89  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  50 
 
 		 373 aa  330  2e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  48.36 
 
 		 387 aa  331  2e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  47.14 
 
 		 388 aa  330  3e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  46.07 
 
 		 428 aa  329  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  47.34 
 
 		 386 aa  329  7e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  45.88 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  50.3 
 
 		 382 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  50.3 
 
 		 382 aa  325  7e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  46.99 
 
 		 409 aa  325  9e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  45.48 
 
 		 386 aa  325  9e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  50.89 
 
 		 382 aa  324  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  46.72 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  49.06 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  46.72 
 
 		 409 aa  324  2e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  46.72 
 
 		 397 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  49.7 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  49.01 
 
 		 353 aa  323  3e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  49.3 
 
 		 378 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  47.15 
 
 		 412 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  50.73 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  47.15 
 
 		 412 aa  322  6e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  49.73 
 
 		 373 aa  322  8e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.15 
 
 		 379 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  49.41 
 
 		 381 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.53 
 
 		 398 aa  320  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  49.87 
 
 		 385 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  46.92 
 
 		 425 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  46.44 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  53.1 
 
 		 415 aa  319  5e-86  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  47.41 
 
 		 418 aa  319  5e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.83 
 
 		 396 aa  317  2e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  48.52 
 
 		 420 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  44.3 
 
 		 404 aa  317  3e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  47.15 
 
 		 412 aa  317  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  47.9 
 
 		 450 aa  316  6e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  47.59 
 
 		 424 aa  315  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  47.01 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  47.44 
 
 		 432 aa  315  7e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  47.01 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  47.01 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  47.01 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  47.01 
 
 		 397 aa  315  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  47.44 
 
 		 432 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.36 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  44.36 
 
 		 385 aa  315  9e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>