More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3468 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
393 aa  776    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  54.86 
 
 
392 aa  403  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.8 
 
 
395 aa  384  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.56 
 
 
422 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  51.94 
 
 
405 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  54.69 
 
 
400 aa  373  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  57.35 
 
 
394 aa  372  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  55.27 
 
 
395 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.36 
 
 
399 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.56 
 
 
433 aa  363  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  49.87 
 
 
379 aa  363  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1335  RND family efflux transporter MFP subunit  57.73 
 
 
385 aa  363  4e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  55.23 
 
 
412 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  55.43 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.28 
 
 
410 aa  362  6e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  54.69 
 
 
400 aa  362  9e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  52.8 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  52.8 
 
 
395 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  52.8 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.35 
 
 
411 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  51.58 
 
 
390 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  50.52 
 
 
386 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  55.06 
 
 
381 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  53.51 
 
 
446 aa  352  8e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.74 
 
 
386 aa  351  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  52.03 
 
 
405 aa  351  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.22 
 
 
446 aa  350  2e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.6 
 
 
396 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  50.4 
 
 
386 aa  348  6e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  52.86 
 
 
382 aa  348  7e-95  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 
379 aa  348  9e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.83 
 
 
398 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  51.04 
 
 
409 aa  347  2e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  50.78 
 
 
409 aa  347  3e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  50.78 
 
 
409 aa  346  5e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  50.78 
 
 
397 aa  345  5e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  55.76 
 
 
395 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  50.41 
 
 
385 aa  343  4e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  50.41 
 
 
385 aa  342  5e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  49.17 
 
 
381 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  47.67 
 
 
397 aa  342  7e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.14 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  50.14 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  50.14 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 
385 aa  341  1e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  51.45 
 
 
394 aa  341  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  50.39 
 
 
442 aa  340  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  49.72 
 
 
381 aa  340  2e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.46 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  50.39 
 
 
383 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.89 
 
 
381 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  48.89 
 
 
381 aa  339  4e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  49.86 
 
 
385 aa  339  4e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  49.86 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  49.86 
 
 
385 aa  339  5.9999999999999996e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  49.86 
 
 
379 aa  338  9.999999999999999e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  50.82 
 
 
384 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  50.88 
 
 
480 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  50.55 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  52.41 
 
 
450 aa  336  3.9999999999999995e-91  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  56.01 
 
 
415 aa  336  5e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  50.77 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  50.77 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  50.77 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  50.77 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  50.77 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.55 
 
 
384 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  50.69 
 
 
382 aa  335  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  47.64 
 
 
386 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 
382 aa  334  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 
382 aa  333  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
384 aa  333  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 
386 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  47.28 
 
 
383 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  53.55 
 
 
409 aa  332  5e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  51.92 
 
 
378 aa  332  5e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  49.17 
 
 
382 aa  332  5e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4025  RND family efflux transporter MFP subunit  57.14 
 
 
383 aa  332  6e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.503943  normal  0.259915 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.86 
 
 
399 aa  332  8e-90  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  49.87 
 
 
386 aa  331  1e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  52.89 
 
 
385 aa  331  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  51.34 
 
 
423 aa  332  1e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  45.5 
 
 
426 aa  330  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  49.32 
 
 
382 aa  328  9e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  51.25 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  51.25 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  51.25 
 
 
385 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  53.14 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  49.43 
 
 
378 aa  327  2.0000000000000001e-88  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  48.6 
 
 
353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  50.97 
 
 
387 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  50.7 
 
 
383 aa  325  8.000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  46.51 
 
 
383 aa  323  2e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  48.25 
 
 
425 aa  324  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.27 
 
 
403 aa  324  2e-87  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>