More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0389 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 434 aa  851    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  75.38 
 
 		 436 aa  566  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  77.81 
 
 		 433 aa  558  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  71.89 
 
 		 428 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  69.65 
 
 		 430 aa  504  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  69.45 
 
 		 424 aa  467  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  68.39 
 
 		 430 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  64.22 
 
 		 430 aa  430  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  58.85 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  63.22 
 
 		 404 aa  404  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  53.92 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  57.63 
 
 		 398 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.89 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.89 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  48.72 
 
 		 392 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  54.38 
 
 		 415 aa  352  7e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.09 
 
 		 422 aa  349  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  51.1 
 
 		 425 aa  348  9e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.83 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  52.55 
 
 		 381 aa  338  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  51.37 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  51.37 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  51.37 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  52.1 
 
 		 432 aa  334  1e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  51.65 
 
 		 420 aa  334  1e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  51.54 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  50.82 
 
 		 420 aa  330  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  51.45 
 
 		 431 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  50.67 
 
 		 391 aa  330  3e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  47.52 
 
 		 395 aa  330  4e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  50.82 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.82 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.82 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.82 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.82 
 
 		 420 aa  329  7e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.82 
 
 		 420 aa  328  8e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  50.81 
 
 		 412 aa  328  8e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.03 
 
 		 395 aa  328  9e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  50.81 
 
 		 412 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  47.46 
 
 		 400 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.11 
 
 		 394 aa  326  6e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  48.45 
 
 		 418 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  49.59 
 
 		 391 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  50.14 
 
 		 412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.8 
 
 		 410 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.84 
 
 		 411 aa  319  6e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  45.11 
 
 		 385 aa  318  1e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.73 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  50 
 
 		 386 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  47.87 
 
 		 409 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  47.61 
 
 		 397 aa  316  5e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  47.61 
 
 		 409 aa  315  7e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.06 
 
 		 412 aa  315  9e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  47.61 
 
 		 409 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  49.73 
 
 		 391 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.11 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.05 
 
 		 393 aa  313  4.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  52.44 
 
 		 395 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  49.61 
 
 		 410 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.93 
 
 		 398 aa  312  6.999999999999999e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  47.33 
 
 		 386 aa  311  2e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  49 
 
 		 384 aa  310  4e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  45.09 
 
 		 405 aa  310  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  47.24 
 
 		 385 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.86 
 
 		 385 aa  309  6.999999999999999e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  46.28 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.14 
 
 		 446 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  48.01 
 
 		 423 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.12 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.45 
 
 		 410 aa  307  3e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  44.86 
 
 		 441 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  43.83 
 
 		 385 aa  306  4.0000000000000004e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  48.19 
 
 		 397 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  43.83 
 
 		 385 aa  305  8.000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.7 
 
 		 397 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  48.43 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.57 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  45.71 
 
 		 406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  43.57 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  45.5 
 
 		 385 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  45.82 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  45.5 
 
 		 385 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  45.25 
 
 		 388 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  45.5 
 
 		 385 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  43.57 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  45.25 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  43.57 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  45.25 
 
 		 395 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  43.57 
 
 		 385 aa  303  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  44.48 
 
 		 386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  43.31 
 
 		 385 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  45.27 
 
 		 447 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  43.31 
 
 		 385 aa  302  8.000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.87 
 
 		 396 aa  301  1e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>