More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2192 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 408 aa  825    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  84.3 
 
 		 428 aa  679    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1939  RND family efflux transporter MFP subunit  75.44 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0238209  hitchhiker  0.000755342 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2037  RND family efflux transporter MFP subunit  75.44 
 
 		 418 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.421969  normal  0.135437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1992  secretion protein HlyD family protein  75.44 
 
 		 418 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.125579  normal  0.0134883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.9 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  36.89 
 
 		 428 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  34.11 
 
 		 412 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  36.31 
 
 		 425 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  34.96 
 
 		 405 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  35.59 
 
 		 422 aa  206  5e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  36.49 
 
 		 412 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 405 aa  202  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 407 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  35.63 
 
 		 434 aa  201  3e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 416 aa  201  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.44 
 
 		 424 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  34.25 
 
 		 372 aa  199  6e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 560 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  35.77 
 
 		 431 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  31.79 
 
 		 391 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  35.36 
 
 		 433 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 411 aa  196  8.000000000000001e-49  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.87 
 
 		 395 aa  195  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 406 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  37.69 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  34.49 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  34.57 
 
 		 412 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.63 
 
 		 383 aa  194  3e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 420 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.69 
 
 		 401 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 430 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.49 
 
 		 410 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 420 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  30.79 
 
 		 396 aa  192  7e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 411 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  31.06 
 
 		 396 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.79 
 
 		 393 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  36.97 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  35.94 
 
 		 428 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.53 
 
 		 386 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  36.24 
 
 		 420 aa  191  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 368 aa  191  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.25 
 
 		 410 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  34.68 
 
 		 430 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 386 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.99 
 
 		 422 aa  189  5.999999999999999e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 		 412 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 		 432 aa  189  1e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  36.59 
 
 		 411 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  31.96 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  33.42 
 
 		 393 aa  188  1e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 397 aa  189  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  31.84 
 
 		 389 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  36.28 
 
 		 411 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3304  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.52 
 
 		 414 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  36.83 
 
 		 385 aa  187  4e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  32.84 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 404 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.21 
 
 		 412 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  37.74 
 
 		 376 aa  186  6e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  31.2 
 
 		 434 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  36.25 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  36.21 
 
 		 432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 425 aa  184  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  32.56 
 
 		 428 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  33.77 
 
 		 381 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5495  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.43 
 
 		 384 aa  182  6e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.318515  normal  0.60957 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  32.55 
 
 		 401 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  32.79 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  32.6 
 
 		 386 aa  182  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.69 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  34.04 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  31.54 
 
 		 418 aa  182  1e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  34.5 
 
 		 395 aa  181  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  32.69 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 407 aa  181  2e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  34.73 
 
 		 386 aa  181  2e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  33.8 
 
 		 431 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6004  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  32.59 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00823963 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  34.64 
 
 		 400 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  31.98 
 
 		 392 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 382 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  32.23 
 
 		 405 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  34.6 
 
 		 398 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1218  secretion protein HlyD  35.18 
 
 		 402 aa  180  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.902251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  36.41 
 
 		 410 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 		 412 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>