More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1562 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 371 aa  722    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  86.02 
 
 		 372 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  78.3 
 
 		 374 aa  527  1e-148  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.3 
 
 		 374 aa  526  1e-148  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  57.14 
 
 		 369 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  55.46 
 
 		 373 aa  381  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.8 
 
 		 376 aa  360  1e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.32 
 
 		 393 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  43.14 
 
 		 369 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  42.59 
 
 		 445 aa  249  5e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  42.46 
 
 		 411 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  42.18 
 
 		 411 aa  246  4e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  41.49 
 
 		 386 aa  243  5e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.05 
 
 		 436 aa  242  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  41.98 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  40.53 
 
 		 426 aa  238  1e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  42.71 
 
 		 382 aa  229  8e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.96 
 
 		 408 aa  228  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.11 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  37.43 
 
 		 368 aa  200  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  37.66 
 
 		 373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  37.86 
 
 		 414 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.89 
 
 		 400 aa  196  7e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  38.24 
 
 		 396 aa  195  9e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 416 aa  193  5e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 430 aa  193  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  37.39 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 400 aa  193  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 394 aa  192  6e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 		 480 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  33.97 
 
 		 405 aa  192  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  35.83 
 
 		 412 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  37.58 
 
 		 383 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 396 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.49 
 
 		 396 aa  190  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.62 
 
 		 373 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  34.38 
 
 		 372 aa  189  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  38.27 
 
 		 403 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  35.54 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.69 
 
 		 395 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  34.33 
 
 		 393 aa  187  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  36.28 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  33.64 
 
 		 389 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  35.83 
 
 		 385 aa  186  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  35.95 
 
 		 417 aa  185  9e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.27 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 378 aa  185  1.0000000000000001e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.54 
 
 		 392 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.06 
 
 		 446 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  32.98 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  37.19 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 430 aa  184  3e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  37.06 
 
 		 446 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  34.51 
 
 		 408 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  34.43 
 
 		 396 aa  182  8.000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 423 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  36.57 
 
 		 411 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.93 
 
 		 399 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  32.97 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2649  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 387 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  34.26 
 
 		 381 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 400 aa  180  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  31.81 
 
 		 385 aa  180  4e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  35.8 
 
 		 383 aa  180  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.23 
 
 		 390 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  34.15 
 
 		 441 aa  179  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  33.07 
 
 		 403 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 428 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  34.58 
 
 		 412 aa  180  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  34.15 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1112  transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  35.71 
 
 		 438 aa  178  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.794261  normal  0.680549 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 384 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  31.49 
 
 		 400 aa  178  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  35.64 
 
 		 382 aa  178  1e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  33.33 
 
 		 398 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.14 
 
 		 393 aa  178  2e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 381 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.78 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  35.78 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4427  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 394 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  36.53 
 
 		 396 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  35.78 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.62 
 
 		 469 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  34.48 
 
 		 395 aa  177  4e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35 
 
 		 399 aa  176  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  36.07 
 
 		 384 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  36.36 
 
 		 409 aa  176  6e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  35.91 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  35.76 
 
 		 410 aa  176  7e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  33.98 
 
 		 381 aa  176  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  35.03 
 
 		 447 aa  175  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  35.37 
 
 		 399 aa  175  9e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.71 
 
 		 415 aa  175  9e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>