More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2649 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2649  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 387 aa  772    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  44.85 
 
 		 445 aa  315  6e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.97 
 
 		 436 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.43 
 
 		 441 aa  291  1e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  45.11 
 
 		 386 aa  289  7e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  43.8 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  41.69 
 
 		 369 aa  278  1e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.49 
 
 		 393 aa  272  8.000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.95 
 
 		 408 aa  269  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  42.01 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  43.14 
 
 		 382 aa  250  3e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  37.7 
 
 		 411 aa  231  2e-59  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  37.43 
 
 		 411 aa  229  6e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 373 aa  204  2e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 		 369 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.59 
 
 		 376 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.12 
 
 		 392 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.55 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 372 aa  192  7e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 416 aa  191  2e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 374 aa  190  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  32.8 
 
 		 368 aa  189  5e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.15 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  34.32 
 
 		 405 aa  186  6e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  35.96 
 
 		 375 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 373 aa  182  9.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  35.47 
 
 		 396 aa  179  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  33.16 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  30.99 
 
 		 372 aa  179  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  33.16 
 
 		 418 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.1 
 
 		 422 aa  179  7e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.2 
 
 		 396 aa  177  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  35.6 
 
 		 400 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 418 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 386 aa  176  7e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1567  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.81 
 
 		 408 aa  175  9.999999999999999e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.351926 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 386 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 		 399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  35.53 
 
 		 405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  34.25 
 
 		 417 aa  173  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 399 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  35.42 
 
 		 423 aa  172  9e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  32.75 
 
 		 394 aa  172  9e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  35.13 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 385 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  29.6 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  34.56 
 
 		 392 aa  171  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  35.49 
 
 		 430 aa  170  3e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  30.91 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  33.85 
 
 		 415 aa  170  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 385 aa  170  4e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.83 
 
 		 422 aa  170  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 376 aa  169  8e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  32.34 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  33.51 
 
 		 411 aa  169  1e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  34.68 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.7 
 
 		 436 aa  167  2e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  29.89 
 
 		 403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.59 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  32.46 
 
 		 383 aa  167  4e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2435  hypothetical protein  33.6 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  32.03 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  34.21 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2581  hypothetical protein  33.6 
 
 		 384 aa  166  6.9999999999999995e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  32.53 
 
 		 381 aa  166  6.9999999999999995e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  34.81 
 
 		 425 aa  166  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  34.14 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2372  RND family efflux transporter MFP subunit  32.83 
 
 		 395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.4 
 
 		 428 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.01 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  31.01 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.9 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  32.12 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  35.5 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  30.08 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  34.67 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  32.4 
 
 		 384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  33.33 
 
 		 430 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 397 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  32.05 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.73 
 
 		 382 aa  160  5e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  31.52 
 
 		 396 aa  160  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  32.58 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  32.58 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  29.73 
 
 		 379 aa  159  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  32.95 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  33.52 
 
 		 393 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  32.68 
 
 		 427 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  30.18 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 386 aa  158  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  34.83 
 
 		 409 aa  157  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  32.6 
 
 		 426 aa  158  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>