More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00481 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  100 
 
 		 434 aa  861    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  65.07 
 
 		 396 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  64.8 
 
 		 396 aa  496  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.17 
 
 		 422 aa  444  1e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  43.86 
 
 		 403 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.99 
 
 		 423 aa  285  8e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.99 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  45.66 
 
 		 381 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  43.7 
 
 		 415 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  44.5 
 
 		 412 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.92 
 
 		 410 aa  277  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  45 
 
 		 398 aa  272  7e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.94 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  42.9 
 
 		 425 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  42.38 
 
 		 426 aa  268  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.71 
 
 		 424 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  41.87 
 
 		 430 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  40.87 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  40.93 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  40.87 
 
 		 418 aa  265  1e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  41.62 
 
 		 428 aa  265  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  43.14 
 
 		 420 aa  263  4e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  43.33 
 
 		 424 aa  263  6e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  40.23 
 
 		 390 aa  261  2e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  43.18 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  43.18 
 
 		 424 aa  260  4e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  43.13 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  43.13 
 
 		 412 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.5 
 
 		 395 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 422 aa  258  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.89 
 
 		 433 aa  256  5e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  43.22 
 
 		 432 aa  256  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  40.33 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.95 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  41.67 
 
 		 434 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  39.66 
 
 		 405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  44.19 
 
 		 415 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  42.66 
 
 		 389 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.51 
 
 		 393 aa  252  1e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.52 
 
 		 386 aa  251  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  42.37 
 
 		 432 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  42.66 
 
 		 412 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  39.94 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  39.94 
 
 		 388 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 395 aa  250  4e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  39.23 
 
 		 386 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  41.74 
 
 		 420 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  41.74 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  41.74 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.86 
 
 		 393 aa  248  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  41.81 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  41.74 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.54 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  42.11 
 
 		 430 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  41.74 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  41.74 
 
 		 420 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  40.7 
 
 		 391 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  41.74 
 
 		 420 aa  248  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 382 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  39.89 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  38.4 
 
 		 386 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  39.61 
 
 		 385 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  39.61 
 
 		 385 aa  244  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.5 
 
 		 391 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  38.95 
 
 		 400 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  39.26 
 
 		 385 aa  244  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  39.52 
 
 		 433 aa  243  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  42 
 
 		 416 aa  243  6e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  38.93 
 
 		 385 aa  242  9e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 386 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  39.04 
 
 		 385 aa  241  2e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  41.42 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.93 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  38.93 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  37.74 
 
 		 386 aa  240  2.9999999999999997e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  38.93 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  38.93 
 
 		 385 aa  240  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  38.93 
 
 		 385 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  37.7 
 
 		 386 aa  240  4e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.31 
 
 		 397 aa  239  5e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  39.24 
 
 		 442 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  39.24 
 
 		 383 aa  239  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  42.14 
 
 		 394 aa  239  5.999999999999999e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  38.67 
 
 		 385 aa  239  8e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.17 
 
 		 396 aa  239  9e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  39.62 
 
 		 400 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  38.67 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.28 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  38.67 
 
 		 385 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  38.33 
 
 		 384 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.94 
 
 		 436 aa  238  2e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>