More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03361 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  99.48 
 
 
385 aa  776    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  99.48 
 
 
385 aa  774    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  100 
 
 
385 aa  778    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  57.71 
 
 
395 aa  419  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  56.08 
 
 
395 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  56.35 
 
 
388 aa  404  1e-111  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  56.08 
 
 
395 aa  403  1e-111  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  55.27 
 
 
397 aa  400  9.999999999999999e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.79 
 
 
395 aa  397  1e-109  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.38 
 
 
397 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.81 
 
 
398 aa  388  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  56.1 
 
 
390 aa  390  1e-107  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.58 
 
 
396 aa  386  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 
409 aa  382  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 
397 aa  382  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  54.45 
 
 
409 aa  382  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  54.19 
 
 
409 aa  381  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  53.71 
 
 
397 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  53.71 
 
 
397 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  53.71 
 
 
397 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  53.71 
 
 
397 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  53.71 
 
 
397 aa  369  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 
379 aa  358  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  49.74 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  48.68 
 
 
385 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  49.48 
 
 
385 aa  356  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.48 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  49.48 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  49.48 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  49.48 
 
 
385 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  50.4 
 
 
385 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  50.4 
 
 
385 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  50.4 
 
 
385 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  49.21 
 
 
385 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  49.21 
 
 
385 aa  353  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  50.13 
 
 
385 aa  349  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  49.6 
 
 
392 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.19 
 
 
422 aa  344  2e-93  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.66 
 
 
433 aa  342  5.999999999999999e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  49.6 
 
 
400 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.27 
 
 
403 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  48.48 
 
 
426 aa  329  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  48.09 
 
 
425 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  50.74 
 
 
400 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  50.55 
 
 
420 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.01 
 
 
386 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  46.67 
 
 
383 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  47.31 
 
 
405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  46.67 
 
 
442 aa  327  3e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.27 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.27 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.27 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.27 
 
 
420 aa  325  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  50.27 
 
 
420 aa  325  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  48.48 
 
 
381 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  47.63 
 
 
382 aa  325  7e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  47.48 
 
 
405 aa  325  9e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  47.87 
 
 
431 aa  325  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.99 
 
 
381 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  45.99 
 
 
381 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  47.71 
 
 
387 aa  324  1e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  45.53 
 
 
382 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  45.79 
 
 
382 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  45.79 
 
 
382 aa  323  4e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
420 aa  322  6e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  45.72 
 
 
381 aa  322  7e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  47.59 
 
 
394 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  51.54 
 
 
450 aa  320  3e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  47.55 
 
 
412 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  47.55 
 
 
412 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  50.27 
 
 
395 aa  316  4e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  50.15 
 
 
432 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.45 
 
 
410 aa  315  6e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.21 
 
 
399 aa  315  8e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  44.59 
 
 
381 aa  315  9e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  46.13 
 
 
383 aa  315  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  48.36 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  47.3 
 
 
423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  47.54 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  47.54 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  50.15 
 
 
432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  47.54 
 
 
424 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.05 
 
 
386 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 
394 aa  313  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  47.49 
 
 
428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  49.85 
 
 
416 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  49.27 
 
 
412 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  45.53 
 
 
382 aa  311  9e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>