More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_2035 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  100 
 
 		 430 aa  845    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  83.29 
 
 		 430 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  76.95 
 
 		 424 aa  529  1e-149  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  72.36 
 
 		 428 aa  509  1e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  72.93 
 
 		 434 aa  490  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.91 
 
 		 436 aa  477  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  69.62 
 
 		 430 aa  475  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  69.4 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  66.58 
 
 		 404 aa  424  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  61.89 
 
 		 408 aa  413  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  57.51 
 
 		 415 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.52 
 
 		 423 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.52 
 
 		 469 aa  385  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  60.83 
 
 		 398 aa  374  1e-102  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  52.33 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  59.83 
 
 		 415 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.68 
 
 		 422 aa  359  6e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  52.86 
 
 		 405 aa  354  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.16 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  51.75 
 
 		 425 aa  349  5e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  53.97 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.89 
 
 		 411 aa  342  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  50.55 
 
 		 391 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  49.06 
 
 		 395 aa  341  2e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.63 
 
 		 410 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  52.37 
 
 		 412 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  52.69 
 
 		 424 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  51.18 
 
 		 400 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  52.56 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  52.56 
 
 		 424 aa  335  1e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  54.01 
 
 		 431 aa  334  2e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  52.36 
 
 		 418 aa  333  3e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.61 
 
 		 398 aa  332  7.000000000000001e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  46.67 
 
 		 406 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  52.52 
 
 		 412 aa  330  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  52.52 
 
 		 412 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.93 
 
 		 395 aa  330  4e-89  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  48.62 
 
 		 394 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  49.06 
 
 		 385 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  51.76 
 
 		 420 aa  326  5e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.13 
 
 		 399 aa  325  9e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  48.24 
 
 		 405 aa  325  1e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  50.39 
 
 		 391 aa  324  2e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  53.19 
 
 		 412 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  53.35 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  53.35 
 
 		 432 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  51.22 
 
 		 420 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  47.18 
 
 		 409 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  46.52 
 
 		 386 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.22 
 
 		 420 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.52 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  48.4 
 
 		 386 aa  320  3e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  48.63 
 
 		 385 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  47.18 
 
 		 409 aa  320  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  46.92 
 
 		 409 aa  319  5e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  46.84 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  47.33 
 
 		 383 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  48.95 
 
 		 387 aa  319  6e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  46.84 
 
 		 418 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  48.79 
 
 		 397 aa  318  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.35 
 
 		 391 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  47.07 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4503  RND family efflux transporter MFP subunit  50.44 
 
 		 384 aa  318  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.148496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  49.35 
 
 		 391 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  46.92 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  46.92 
 
 		 395 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5151  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.72 
 
 		 385 aa  316  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  49.45 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.73 
 
 		 397 aa  315  8e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  47.03 
 
 		 388 aa  315  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  46.32 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  49.87 
 
 		 394 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  48.67 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  48.4 
 
 		 384 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  48.31 
 
 		 367 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  47.45 
 
 		 386 aa  312  5.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  47.87 
 
 		 384 aa  312  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.4 
 
 		 384 aa  312  9e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  46.65 
 
 		 385 aa  312  9e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.27 
 
 		 396 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  46.92 
 
 		 385 aa  311  1e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  48.53 
 
 		 397 aa  311  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3539  secretion protein HlyD  47.97 
 
 		 402 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  49.16 
 
 		 387 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  46.65 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.65 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  46.65 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  46.65 
 
 		 385 aa  310  4e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.92 
 
 		 393 aa  310  4e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6935  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  46.28 
 
 		 377 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.532768  normal  0.737034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>