More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1011 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 395 aa  797    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  82.29 
 
 		 396 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  74.25 
 
 		 398 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  76.84 
 
 		 397 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  71.54 
 
 		 395 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  71.11 
 
 		 409 aa  548  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  70.85 
 
 		 397 aa  548  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  69.03 
 
 		 395 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  70.73 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  69.03 
 
 		 395 aa  547  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  70.85 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  70.85 
 
 		 409 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  69.44 
 
 		 388 aa  538  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  69.95 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  69.95 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  69.95 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  69.95 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  69.95 
 
 		 397 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  64.99 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  496  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  64.99 
 
 		 385 aa  495  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  497  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  64.72 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  64.72 
 
 		 385 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  64.72 
 
 		 385 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  64.99 
 
 		 385 aa  473  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  64.72 
 
 		 385 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  61.21 
 
 		 379 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  63.87 
 
 		 390 aa  461  1e-129  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.72 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  57.69 
 
 		 392 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.35 
 
 		 386 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  55.35 
 
 		 386 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.91 
 
 		 433 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  52.16 
 
 		 405 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  51.54 
 
 		 385 aa  395  1e-109  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  51.79 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  51.54 
 
 		 385 aa  394  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  56.08 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  55.43 
 
 		 382 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  53.66 
 
 		 386 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  56.14 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.84 
 
 		 399 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.56 
 
 		 384 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.7 
 
 		 442 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  53.63 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  52.57 
 
 		 425 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  54.7 
 
 		 384 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  57.56 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  53.97 
 
 		 383 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.17 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  54.86 
 
 		 381 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  56.09 
 
 		 412 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  55.26 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.52 
 
 		 410 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  53.31 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  52.82 
 
 		 428 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.94 
 
 		 393 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.65 
 
 		 411 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  53.62 
 
 		 394 aa  365  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  51.66 
 
 		 426 aa  368  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  51.61 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  52.65 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  52.57 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  49.35 
 
 		 383 aa  365  1e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.2 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  51.2 
 
 		 381 aa  364  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  52.57 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  52.65 
 
 		 412 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  52.57 
 
 		 424 aa  364  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  55.33 
 
 		 418 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  55.03 
 
 		 412 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  50.53 
 
 		 405 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  50.93 
 
 		 381 aa  361  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  54.87 
 
 		 432 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  55.49 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.21 
 
 		 386 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  50.67 
 
 		 382 aa  358  6e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  54.86 
 
 		 415 aa  358  8e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  51.49 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  50.93 
 
 		 381 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  50.67 
 
 		 382 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.49 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.49 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  51.49 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>