More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0287 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  100 
 
 		 394 aa  788    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  66.14 
 
 		 392 aa  508  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  67.57 
 
 		 400 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  66.94 
 
 		 399 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.73 
 
 		 422 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  62.53 
 
 		 433 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  67.3 
 
 		 395 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  61.6 
 
 		 394 aa  435  1e-121  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  57.71 
 
 		 405 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  59.1 
 
 		 423 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  57.65 
 
 		 442 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  57.92 
 
 		 383 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  55.38 
 
 		 400 aa  383  1e-105  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  58.43 
 
 		 409 aa  379  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  54.79 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.52 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  53.37 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  53.37 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  53.78 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  53.37 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  54.79 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  54.52 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.89 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  52.68 
 
 		 397 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  55.46 
 
 		 387 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  54.11 
 
 		 382 aa  371  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  52.6 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  59.29 
 
 		 415 aa  367  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  52.37 
 
 		 425 aa  368  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  51.78 
 
 		 428 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  51.51 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  51.51 
 
 		 418 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.77 
 
 		 410 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.05 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  54.04 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  54.04 
 
 		 412 aa  363  3e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  53.57 
 
 		 381 aa  362  4e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  50.96 
 
 		 418 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  53.48 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  53.48 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  53.48 
 
 		 424 aa  362  6e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  53.76 
 
 		 431 aa  362  7.0000000000000005e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  51.81 
 
 		 379 aa  361  1e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  53.8 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  52.72 
 
 		 397 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  52.67 
 
 		 418 aa  361  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  52.09 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.6 
 
 		 386 aa  360  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  53.8 
 
 		 409 aa  360  2e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  53.59 
 
 		 382 aa  361  2e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  53.53 
 
 		 409 aa  360  4e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  53.95 
 
 		 412 aa  359  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  53.42 
 
 		 450 aa  359  4e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  52.53 
 
 		 420 aa  359  5e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  54.34 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  55.18 
 
 		 386 aa  359  6e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  53.37 
 
 		 420 aa  358  7e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  53.87 
 
 		 385 aa  358  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.65 
 
 		 420 aa  358  8e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.37 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  53.37 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  55.94 
 
 		 383 aa  357  9.999999999999999e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  50.66 
 
 		 381 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.37 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  51.49 
 
 		 431 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.37 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  53.37 
 
 		 420 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  55.77 
 
 		 412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.66 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  50.66 
 
 		 381 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.77 
 
 		 411 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.5 
 
 		 415 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  52.49 
 
 		 386 aa  356  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  50.95 
 
 		 400 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.63 
 
 		 398 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  50.57 
 
 		 405 aa  353  4e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  52.63 
 
 		 378 aa  352  5e-96  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  52.62 
 
 		 401 aa  352  7e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  51.1 
 
 		 385 aa  352  8e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  48.91 
 
 		 386 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.39 
 
 		 397 aa  350  2e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  54.73 
 
 		 381 aa  350  2e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  52.82 
 
 		 432 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  48.91 
 
 		 386 aa  350  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  52.82 
 
 		 432 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.93 
 
 		 405 aa  349  6e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 382 aa  348  7e-95  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 382 aa  348  1e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2557  secretion protein HlyD  52.75 
 
 		 379 aa  347  2e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 382 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  49.6 
 
 		 382 aa  345  6e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.3 
 
 		 396 aa  345  6e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  51.9 
 
 		 373 aa  345  8e-94  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  52.65 
 
 		 384 aa  345  1e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  49.34 
 
 		 379 aa  342  5.999999999999999e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>