More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6204 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  89.82 
 
 		 431 aa  661    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  87.63 
 
 		 420 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  95.2 
 
 		 418 aa  716    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  93.58 
 
 		 425 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  89.15 
 
 		 420 aa  662    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  92.78 
 
 		 432 aa  659    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  95.72 
 
 		 424 aa  698    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  95.72 
 
 		 424 aa  698    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  99.76 
 
 		 412 aa  812    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  98.3 
 
 		 412 aa  804    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  92.51 
 
 		 432 aa  658    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  95.72 
 
 		 424 aa  698    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 412 aa  815    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  87.63 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  87.37 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  87.63 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  87.63 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  87.63 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  87.63 
 
 		 420 aa  634  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  81.48 
 
 		 410 aa  589  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  78.1 
 
 		 410 aa  587  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  82.35 
 
 		 416 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  75.47 
 
 		 405 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  56.66 
 
 		 392 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.11 
 
 		 410 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  61.62 
 
 		 381 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  54.64 
 
 		 386 aa  398  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  59.84 
 
 		 412 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.28 
 
 		 386 aa  393  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  59.95 
 
 		 411 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.38 
 
 		 422 aa  394  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  55.27 
 
 		 442 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  55.53 
 
 		 383 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  56.87 
 
 		 400 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  56.86 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  54.57 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  56.11 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  55.1 
 
 		 384 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.65 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  54.49 
 
 		 394 aa  375  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  53.99 
 
 		 384 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  55.32 
 
 		 398 aa  375  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.72 
 
 		 384 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  51.94 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  51.94 
 
 		 388 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  51.94 
 
 		 395 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  53.68 
 
 		 384 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.18 
 
 		 397 aa  371  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  54.77 
 
 		 397 aa  370  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  55.67 
 
 		 398 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  57.14 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  53.24 
 
 		 382 aa  362  6e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  52.28 
 
 		 409 aa  361  1e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  52.03 
 
 		 409 aa  360  3e-98  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  54.55 
 
 		 385 aa  360  3e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  56.94 
 
 		 394 aa  359  4e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  52.03 
 
 		 397 aa  359  5e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  51.78 
 
 		 409 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  53.21 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  51.23 
 
 		 428 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  58.05 
 
 		 395 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  53.95 
 
 		 423 aa  350  3e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  51.53 
 
 		 390 aa  348  8e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  51.89 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  56.97 
 
 		 409 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  49.6 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  49.6 
 
 		 418 aa  347  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.93 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  52.32 
 
 		 386 aa  346  4e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.93 
 
 		 469 aa  346  4e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.92 
 
 		 396 aa  345  8e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  56.2 
 
 		 415 aa  345  8e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  49.07 
 
 		 418 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  48.8 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.8 
 
 		 381 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  48.8 
 
 		 381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6992  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.38 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  54.81 
 
 		 424 aa  341  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  53.13 
 
 		 373 aa  338  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  51.54 
 
 		 415 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  46.9 
 
 		 426 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  50 
 
 		 383 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.85 
 
 		 403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  49.45 
 
 		 385 aa  336  5e-91  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0520  acriflavine resistance protein A  55.03 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0763854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0536  acriflavine resistance protein A  55.03 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0526  acriflavine resistance protein A  55.03 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0517  acriflavine resistance protein A  55.03 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0579  acriflavine resistance protein A  55.03 
 
 		 397 aa  336  5.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0884843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  49.45 
 
 		 385 aa  335  7e-91  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  49.45 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  49.45 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  48.93 
 
 		 382 aa  334  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  49.45 
 
 		 385 aa  335  1e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  50.55 
 
 		 431 aa  334  1e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>