More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_1299 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  98.93 
 
 		 374 aa  721    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 374 aa  728    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  78.71 
 
 		 372 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  78.43 
 
 		 371 aa  528  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  58.16 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  52.02 
 
 		 373 aa  367  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.19 
 
 		 376 aa  330  4e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  42.06 
 
 		 426 aa  246  4.9999999999999997e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  42.18 
 
 		 369 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  40.74 
 
 		 411 aa  236  6e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3560  efflux transporter, RND family, MFP subunit  42.11 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  40.48 
 
 		 411 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  39.95 
 
 		 386 aa  233  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  43.88 
 
 		 382 aa  232  7.000000000000001e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  41.03 
 
 		 445 aa  232  1e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  41.18 
 
 		 381 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.76 
 
 		 436 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.58 
 
 		 408 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  37.82 
 
 		 373 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.16 
 
 		 441 aa  207  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  38.84 
 
 		 381 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  38.86 
 
 		 396 aa  192  1e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  34.94 
 
 		 389 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  37.03 
 
 		 383 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  35.85 
 
 		 404 aa  189  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  36.19 
 
 		 400 aa  189  9e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  35.22 
 
 		 375 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  35.58 
 
 		 368 aa  189  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 		 399 aa  188  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 416 aa  186  5e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.51 
 
 		 396 aa  186  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  36.72 
 
 		 411 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  38.81 
 
 		 400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.58 
 
 		 373 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.2 
 
 		 395 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.2 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1004  HlyD family secretion protein  36.87 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  37.01 
 
 		 385 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  33.24 
 
 		 372 aa  183  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.48 
 
 		 404 aa  182  7e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.6 
 
 		 392 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.78 
 
 		 378 aa  181  2e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  34.24 
 
 		 405 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 405 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 395 aa  179  4.999999999999999e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  35.16 
 
 		 371 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 405 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.58 
 
 		 392 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  36.39 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 405 aa  179  7e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3621  secretion protein HlyD  36.05 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.77 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 400 aa  179  1e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 384 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.41 
 
 		 383 aa  177  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 377 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  35 
 
 		 410 aa  177  4e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  36.87 
 
 		 405 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.43 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  31.82 
 
 		 388 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  31.82 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  36.24 
 
 		 427 aa  176  6e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  32.98 
 
 		 379 aa  176  6e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.82 
 
 		 395 aa  176  6e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  33.04 
 
 		 392 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.9 
 
 		 393 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  36.5 
 
 		 408 aa  175  9e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 		 396 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.57 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  34.14 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.04 
 
 		 427 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 408 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  35.21 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0739  RND family efflux transporter MFP subunit  32.15 
 
 		 371 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.580961  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  35.25 
 
 		 404 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  36.04 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  35.99 
 
 		 381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  32.8 
 
 		 428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  32.96 
 
 		 400 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.02 
 
 		 391 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  34.99 
 
 		 384 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 441 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.25 
 
 		 424 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  34.51 
 
 		 396 aa  173  3.9999999999999995e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2103  hypothetical protein  33.63 
 
 		 365 aa  173  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.15 
 
 		 393 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  37.04 
 
 		 396 aa  173  5e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  32.89 
 
 		 403 aa  173  5e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.04 
 
 		 390 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 423 aa  173  5e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 417 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 469 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.32 
 
 		 381 aa  172  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>