More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0738 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 430 aa  864    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  97.51 
 
 		 396 aa  753    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 359 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  40.06 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  35.87 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.59 
 
 		 416 aa  223  4e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 368 aa  222  8e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  35.83 
 
 		 387 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.57 
 
 		 373 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  39.14 
 
 		 403 aa  220  5e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 391 aa  216  8e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  34.75 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  34.09 
 
 		 385 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  34.16 
 
 		 375 aa  194  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.51 
 
 		 378 aa  192  9e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.04 
 
 		 396 aa  192  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  33.95 
 
 		 411 aa  192  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  33.69 
 
 		 411 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  34.31 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  36.19 
 
 		 381 aa  186  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  34.07 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.11 
 
 		 396 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  34.83 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  35.14 
 
 		 393 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.83 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  34.83 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  34.82 
 
 		 374 aa  183  6e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  34.97 
 
 		 371 aa  181  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.52 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  31.09 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  33.83 
 
 		 369 aa  178  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  31.05 
 
 		 386 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.68 
 
 		 404 aa  177  3e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  32.9 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  34.43 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  33.72 
 
 		 386 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  34.04 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  32.82 
 
 		 404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  31.45 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  34.53 
 
 		 382 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 427 aa  172  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  33.93 
 
 		 381 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  32.96 
 
 		 409 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  32.96 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  32.96 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  32.96 
 
 		 406 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  32.12 
 
 		 396 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  30.12 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 399 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 401 aa  171  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  32.61 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  32 
 
 		 476 aa  171  3e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  33.94 
 
 		 410 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  31.54 
 
 		 412 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  32.29 
 
 		 430 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001385  probable RND efflux membrane fusion protein  33.86 
 
 		 380 aa  170  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.71 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  32.07 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2431  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 435 aa  170  5e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638771  normal  0.904192 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  33.77 
 
 		 411 aa  170  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  32.68 
 
 		 409 aa  170  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  33.02 
 
 		 396 aa  169  6e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  35.28 
 
 		 382 aa  169  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  31.56 
 
 		 396 aa  169  8e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  33.24 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  33.24 
 
 		 387 aa  169  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.93 
 
 		 405 aa  169  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.14 
 
 		 416 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0992  secretion protein HlyD  36.76 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  33.24 
 
 		 385 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  30.66 
 
 		 412 aa  169  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1968  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.94 
 
 		 379 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000223491  normal  0.235934 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.33 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  32.38 
 
 		 435 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  35.57 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.95 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  32.95 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  32.95 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  32.95 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  32.95 
 
 		 385 aa  167  5e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  34.03 
 
 		 445 aa  166  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  30.93 
 
 		 379 aa  166  6.9999999999999995e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1531  secretion protein HlyD  31.67 
 
 		 406 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000126911  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  32.53 
 
 		 400 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 		 391 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 462 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  32.66 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  32.66 
 
 		 385 aa  164  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  33.71 
 
 		 426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  32.87 
 
 		 418 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>