More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0402 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  100 
 
 		 403 aa  809    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.99 
 
 		 373 aa  271  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  42.4 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  40.98 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  36.12 
 
 		 416 aa  234  2.0000000000000002e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  37.47 
 
 		 384 aa  229  6e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 396 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  39.94 
 
 		 430 aa  224  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  41.11 
 
 		 411 aa  222  7e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  40.85 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  38.53 
 
 		 385 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  37.54 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 393 aa  210  3e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  36.87 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  35.16 
 
 		 372 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  36.2 
 
 		 391 aa  205  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  39.38 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 422 aa  204  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  38.33 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 408 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  34.34 
 
 		 387 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  35.08 
 
 		 385 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.86 
 
 		 396 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  37.4 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  37.4 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.86 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  37.4 
 
 		 406 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  37.4 
 
 		 409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 369 aa  197  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  37.4 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 405 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.23 
 
 		 416 aa  196  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 376 aa  196  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  36.17 
 
 		 373 aa  196  7e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  35.35 
 
 		 396 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  38.69 
 
 		 381 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.5 
 
 		 378 aa  195  1e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  36.34 
 
 		 405 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  35.17 
 
 		 428 aa  194  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  38.18 
 
 		 393 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.26 
 
 		 419 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.81 
 
 		 404 aa  194  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  35.13 
 
 		 405 aa  192  9e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  39.31 
 
 		 371 aa  191  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.08 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.63 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5137  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 427 aa  189  5.999999999999999e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259338 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  36.08 
 
 		 396 aa  189  8e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.19 
 
 		 395 aa  189  9e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  35.23 
 
 		 430 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  36.11 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1792  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.567297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  37.69 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  33.88 
 
 		 414 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  36.39 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0711  secretion protein HlyD  35.57 
 
 		 382 aa  183  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.577453  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0849  RND efflux system membrane fusion protein  35.33 
 
 		 418 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.8894  decreased coverage  0.000437743 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  34.5 
 
 		 405 aa  182  8.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  34.09 
 
 		 417 aa  182  1e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  34.47 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  37.46 
 
 		 393 aa  182  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 415 aa  181  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  35.84 
 
 		 433 aa  181  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.88 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  34.84 
 
 		 426 aa  181  2e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.53 
 
 		 436 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  36.63 
 
 		 411 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.22 
 
 		 422 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 377 aa  180  4e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2293  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.24 
 
 		 430 aa  180  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  33.25 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3079  secretion protein HlyD  31.04 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.787711  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  35.48 
 
 		 429 aa  180  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 359 aa  180  4.999999999999999e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6556  RND family efflux transporter MFP subunit  35 
 
 		 399 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.254371  normal  0.769115 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 392 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2436  RND family efflux transporter MFP subunit  35.99 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.66626  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.4 
 
 		 376 aa  179  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.64 
 
 		 390 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  32.18 
 
 		 413 aa  179  8e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4972  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.6 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.956167  normal  0.110468 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.91 
 
 		 441 aa  179  8e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4509  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 381 aa  179  8e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  35.48 
 
 		 399 aa  179  8e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  36.04 
 
 		 373 aa  179  9e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.13 
 
 		 405 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  34.3 
 
 		 383 aa  178  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  35.28 
 
 		 410 aa  178  1e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 394 aa  179  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5024  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.03 
 
 		 381 aa  179  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.815107  normal  0.264656 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  32.21 
 
 		 389 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.63 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  35.11 
 
 		 390 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4225  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.52 
 
 		 436 aa  177  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  36.26 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>