More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2140 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 393 aa  779    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  39.64 
 
 		 416 aa  308  1.0000000000000001e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  38.08 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  37.63 
 
 		 411 aa  219  7.999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  34.42 
 
 		 384 aa  217  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  37.37 
 
 		 411 aa  217  4e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  37.02 
 
 		 403 aa  213  5.999999999999999e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 396 aa  206  5e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 		 417 aa  205  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  32.54 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.9 
 
 		 376 aa  203  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  35.08 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  31 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  34.16 
 
 		 434 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  30.31 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.65 
 
 		 379 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 383 aa  197  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.36 
 
 		 373 aa  195  1e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 385 aa  195  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.84 
 
 		 422 aa  192  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.66 
 
 		 436 aa  192  8e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.8 
 
 		 396 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  34.29 
 
 		 386 aa  187  2e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.28 
 
 		 404 aa  187  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  32.7 
 
 		 403 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  36.76 
 
 		 381 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  34.2 
 
 		 387 aa  184  3e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  34.12 
 
 		 396 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.96 
 
 		 390 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  34.04 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  32.77 
 
 		 379 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  32.14 
 
 		 369 aa  182  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  33.08 
 
 		 405 aa  182  7e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.42 
 
 		 560 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  31.4 
 
 		 387 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3808  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.88 
 
 		 398 aa  181  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0283024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  29.46 
 
 		 372 aa  182  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 422 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.69 
 
 		 410 aa  180  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.46 
 
 		 396 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2285  RND family efflux transporter MFP subunit  30.42 
 
 		 428 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134622 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  32.97 
 
 		 404 aa  179  7e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.26 
 
 		 412 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  33.8 
 
 		 386 aa  178  1e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  33.24 
 
 		 385 aa  178  1e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0996  RND family efflux transporter MFP subunit  34.06 
 
 		 397 aa  178  2e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  32.6 
 
 		 394 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  32.16 
 
 		 393 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.25 
 
 		 392 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  32.95 
 
 		 385 aa  176  4e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.46 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  33.54 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  31.73 
 
 		 445 aa  176  7e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.16 
 
 		 411 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  30.67 
 
 		 411 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2568  secretion protein HlyD  30.93 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.807298  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.73 
 
 		 436 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  34.02 
 
 		 384 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  32.13 
 
 		 412 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.86 
 
 		 416 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 385 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 382 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  31.92 
 
 		 428 aa  173  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  32.87 
 
 		 378 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 405 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  35.07 
 
 		 391 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  33.07 
 
 		 384 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  30.49 
 
 		 386 aa  173  5.999999999999999e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  33.7 
 
 		 425 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  32.05 
 
 		 383 aa  172  9e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.38 
 
 		 395 aa  172  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  33.82 
 
 		 382 aa  172  1e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  32.59 
 
 		 381 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4642  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.48 
 
 		 383 aa  172  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.195012  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  32.94 
 
 		 382 aa  171  1e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  32.53 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  30.42 
 
 		 375 aa  171  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  32.68 
 
 		 387 aa  171  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.82 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  32.12 
 
 		 430 aa  171  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.439492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 393 aa  171  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  35.31 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>