More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2338 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 373 aa  759    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  42.94 
 
 		 403 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  38.27 
 
 		 368 aa  239  5e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  38.71 
 
 		 383 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  36.73 
 
 		 386 aa  223  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1083  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 359 aa  222  8e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0380532  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  40.36 
 
 		 411 aa  214  1.9999999999999998e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  40.06 
 
 		 411 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.74 
 
 		 399 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  37.61 
 
 		 396 aa  211  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  36.75 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  33.06 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 430 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  39.38 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  37.69 
 
 		 396 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  33.97 
 
 		 372 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  34.84 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  35.91 
 
 		 404 aa  204  2e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3094  putative efflux transporter  36.8 
 
 		 393 aa  204  3e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000031387  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.24 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  38.71 
 
 		 369 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 396 aa  202  8e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.26 
 
 		 396 aa  202  9e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.03 
 
 		 405 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  34.76 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  34.13 
 
 		 379 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.6 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  34.93 
 
 		 375 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2639  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.33 
 
 		 436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 445 aa  196  6e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.07 
 
 		 436 aa  195  1e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  35.03 
 
 		 393 aa  195  1e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 391 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  36.61 
 
 		 422 aa  193  5e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 373 aa  192  5e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  34.97 
 
 		 431 aa  192  6e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 373 aa  192  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1361  HlyD family secretion protein  33.86 
 
 		 387 aa  192  1e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.70378  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  36.47 
 
 		 415 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0920  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.71 
 
 		 392 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.392204 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4699  RND family efflux transporter MFP subunit  35.12 
 
 		 405 aa  191  1e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5230  RND family efflux transporter MFP subunit  35.12 
 
 		 405 aa  191  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0639393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3091  RND family efflux transporter MFP subunit  33.9 
 
 		 426 aa  191  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0542008  normal  0.0352029 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3421  secretion protein HlyD  34.79 
 
 		 381 aa  191  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.159892  normal  0.759602 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0513  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 435 aa  191  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.497794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4918  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890764  normal  0.731397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  36.61 
 
 		 381 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3014  secretion protein HlyD  35.39 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5352  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 405 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.730017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.75 
 
 		 401 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  34.49 
 
 		 385 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  35.04 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2106  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 408 aa  189  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  36.62 
 
 		 371 aa  189  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  36.14 
 
 		 397 aa  189  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0295  HlyD family secretion protein  34.85 
 
 		 405 aa  188  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  37.36 
 
 		 378 aa  188  1e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  36.56 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2029  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.32 
 
 		 378 aa  188  2e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.109803  hitchhiker  0.00040221 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.43 
 
 		 394 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  32.74 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  35.73 
 
 		 378 aa  187  2e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2144  multidrug efflux pump BpeE  35.17 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0827  multidrug efflux pump BpeE  35.17 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.747872  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0416  multidrug efflux pump BpeE  35.17 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1466  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1840  RND family efflux transporter MFP subunit  35.17 
 
 		 409 aa  187  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4179  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.49 
 
 		 420 aa  186  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0513  multidrug efflux pump BpeE  35.17 
 
 		 409 aa  186  6e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  34.59 
 
 		 389 aa  186  6e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  33.51 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  36.23 
 
 		 387 aa  186  7e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  34.93 
 
 		 400 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.45 
 
 		 391 aa  185  9e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3045  RND family efflux transporter MFP subunit  37.27 
 
 		 414 aa  185  9e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.06 
 
 		 377 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.01 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.58 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4534  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.452412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  35.22 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  36.05 
 
 		 406 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  35.16 
 
 		 391 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  33.6 
 
 		 382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2140  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 393 aa  184  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  37.58 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  32.77 
 
 		 412 aa  183  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.42 
 
 		 416 aa  183  4.0000000000000006e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  32.31 
 
 		 417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0320  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 407 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 		 402 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  32.79 
 
 		 377 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  34.95 
 
 		 386 aa  182  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  34.44 
 
 		 381 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  36.19 
 
 		 398 aa  182  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2181  RND family efflux transporter MFP subunit  33.71 
 
 		 412 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.179253  normal  0.0467643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5537  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.168619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.46 
 
 		 376 aa  182  1e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 382 aa  181  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4746  RND family efflux transporter MFP subunit  35.61 
 
 		 400 aa  182  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>