More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000504 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000504  probable Co/Zn/Cd efflux system membrane fusion protein  100 
 
 		 375 aa  760    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0015  secretion protein, HlyD family  63.59 
 
 		 372 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1255  RND family efflux transporter MFP subunit  36.93 
 
 		 391 aa  228  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.518513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1356  RND family efflux transporter MFP subunit  37.78 
 
 		 387 aa  226  4e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00018874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3797  RND family efflux transporter MFP subunit  36.49 
 
 		 376 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1536  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 416 aa  222  9e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3829  secretion protein HlyD  40 
 
 		 387 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.192626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0402  secretion protein HlyD  37.25 
 
 		 403 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1163  RND family efflux transporter MFP subunit  36.9 
 
 		 385 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  36.1 
 
 		 445 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.819797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2434  RND family efflux transporter MFP subunit  35.96 
 
 		 383 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.671436  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4140  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.1 
 
 		 436 aa  215  8e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3586  secretion protein HlyD  39.38 
 
 		 369 aa  215  9e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1150  RND family efflux transporter MFP subunit  34.96 
 
 		 384 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1129  secretion protein HlyD  37.02 
 
 		 368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.827247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.99 
 
 		 373 aa  211  2e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0307  HlyD family secretion protein  35.15 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.556263  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0335  HlyD family secretion protein  35.15 
 
 		 411 aa  206  5e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5128  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 441 aa  206  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.982267 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3579  putative transmembrane multidrug efflux system transmembrane protein  35.36 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001385  probable RND efflux membrane fusion protein  37.84 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  36.92 
 
 		 385 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2659  secretion protein HlyD  35.46 
 
 		 417 aa  202  8e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2450  RND family efflux transporter MFP subunit  35.21 
 
 		 373 aa  202  9.999999999999999e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5483  HlyD family secretion protein  35.62 
 
 		 396 aa  201  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0155996  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.89 
 
 		 405 aa  200  3e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3304  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 396 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5362  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.7 
 
 		 377 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1562  RND family efflux transporter MFP subunit  36.28 
 
 		 371 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0941  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.71 
 
 		 419 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.35175  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3099  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexE  34.43 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165228  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  34.55 
 
 		 393 aa  199  7e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2967  secretion protein HlyD  34.7 
 
 		 413 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5071  RND family efflux transporter MFP subunit  34.15 
 
 		 377 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212583  normal  0.0344609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  35.75 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.23 
 
 		 374 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1073  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 412 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000967621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1145  RND family efflux transporter MFP subunit  34.23 
 
 		 412 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00324803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0738  RND family efflux transporter MFP subunit  34.16 
 
 		 430 aa  196  4.0000000000000005e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2792  RND family efflux transporter MFP subunit  33.42 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1077  RND family efflux transporter MFP subunit  33.96 
 
 		 412 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0667  RND family efflux transporter MFP subunit  34.87 
 
 		 396 aa  196  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 396 aa  195  9e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  34.52 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1140  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 374 aa  195  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2511  RND family efflux transporter MFP subunit  35.5 
 
 		 413 aa  195  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504694  normal  0.653168 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.49 
 
 		 399 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0099  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.9 
 
 		 408 aa  194  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4362  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 373 aa  194  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.42 
 
 		 372 aa  194  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.460897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2359  RND family efflux transporter MFP subunit  36.5 
 
 		 392 aa  194  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3365  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.56 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.496799  normal  0.0176512 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0715  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 404 aa  193  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 395 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2448  RND family efflux transporter MFP subunit  35.22 
 
 		 413 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.773044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0142  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 389 aa  194  3e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.285006 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2337  RND family efflux transporter MFP subunit  35.33 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3425  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.33 
 
 		 413 aa  193  5e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3493  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE  33.7 
 
 		 476 aa  193  5e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3096  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.92 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.219805 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5678  RND multidrug efflux membrane permease  34.03 
 
 		 386 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116092  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32400  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  37.22 
 
 		 414 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2745  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  36.31 
 
 		 414 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  33.07 
 
 		 379 aa  191  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0869  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexE precursor  35.71 
 
 		 409 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.988771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  33.88 
 
 		 391 aa  191  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03218  Membrane-fusion protein  32.26 
 
 		 428 aa  190  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0063  RND family efflux transporter MFP subunit  36.47 
 
 		 402 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4124  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 415 aa  190  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.626146  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1362  RND family efflux transporter MFP subunit  35.14 
 
 		 418 aa  189  5e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.168892  decreased coverage  0.00389749 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3181  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 412 aa  189  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2562  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.55 
 
 		 416 aa  189  5e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0757424  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2878  RND family efflux transporter MFP subunit  35.13 
 
 		 396 aa  189  5e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3306  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.86 
 
 		 376 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0124352 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1099  HlyD family secretion protein  34.45 
 
 		 401 aa  189  7e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3182  RND family efflux transporter MFP subunit  33.15 
 
 		 412 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1187  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.15 
 
 		 412 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.917574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4053  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 414 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  32.26 
 
 		 394 aa  189  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1596  HlyD family multidrug efflux protein  32.43 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.616153  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4335  secretion protein HlyD  35.12 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387273  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4352  RND family efflux transporter MFP subunit  34.7 
 
 		 369 aa  188  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0035  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.67 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.792697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  34.22 
 
 		 405 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3325  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 412 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  32.89 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.42 
 
 		 392 aa  187  3e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.89 
 
 		 395 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4669  RND family efflux transporter MFP subunit  34.75 
 
 		 399 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.287204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  34.91 
 
 		 480 aa  186  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  32.89 
 
 		 388 aa  186  4e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3107  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.07 
 
 		 392 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.32243 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6072  RND family efflux transporter MFP subunit  37.76 
 
 		 399 aa  187  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  39.32 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5708  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 429 aa  186  5e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.42 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2311  secretion protein HlyD  36.81 
 
 		 413 aa  186  6e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.592416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4867  cation/multidrug efflux system membrane protein  38.1 
 
 		 411 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00045993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 383 aa  186  6e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>