More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3367 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 480 aa  950    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  76.4 
 
 		 446 aa  538  9.999999999999999e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  73.55 
 
 		 446 aa  514  1e-144  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  58.74 
 
 		 450 aa  393  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  50.41 
 
 		 392 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  49.87 
 
 		 400 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.31 
 
 		 395 aa  339  7e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.59 
 
 		 393 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  46.63 
 
 		 405 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  49.19 
 
 		 382 aa  330  3e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  53.26 
 
 		 415 aa  330  4e-89  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  47.86 
 
 		 397 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  45.59 
 
 		 386 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  48.18 
 
 		 386 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.8 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 		 381 aa  325  9e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  45.41 
 
 		 388 aa  325  1e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  51.79 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  45.41 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  45.41 
 
 		 395 aa  325  1e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  46.8 
 
 		 381 aa  325  1e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.65 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.09 
 
 		 386 aa  323  5e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  49.31 
 
 		 387 aa  322  9.999999999999999e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  48.91 
 
 		 400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  48.12 
 
 		 428 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  46.6 
 
 		 397 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  46.61 
 
 		 386 aa  320  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  47.55 
 
 		 382 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  45.78 
 
 		 379 aa  319  7e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  48.17 
 
 		 383 aa  319  9e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  47.78 
 
 		 382 aa  318  9e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 395 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  47.55 
 
 		 378 aa  318  2e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  46.09 
 
 		 386 aa  318  2e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.35 
 
 		 379 aa  317  3e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  46.97 
 
 		 394 aa  317  3e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  46.24 
 
 		 381 aa  317  3e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50 
 
 		 399 aa  316  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  46.94 
 
 		 382 aa  316  5e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.11 
 
 		 433 aa  316  6e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2479  RND family efflux transporter MFP subunit  46.34 
 
 		 384 aa  316  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  46.94 
 
 		 382 aa  315  9e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  46.36 
 
 		 423 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  44.68 
 
 		 383 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  44.68 
 
 		 442 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  47.04 
 
 		 400 aa  313  4.999999999999999e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  48.82 
 
 		 383 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  46.67 
 
 		 381 aa  312  6.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  46.63 
 
 		 384 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.67 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.71 
 
 		 405 aa  312  1e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  45.43 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1193  HlyD family secretion protein  45.97 
 
 		 386 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000622308  normal  0.342064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  48.73 
 
 		 390 aa  310  4e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.47 
 
 		 384 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  48.55 
 
 		 386 aa  310  5e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  47.97 
 
 		 431 aa  309  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.82 
 
 		 396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 384 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  46.74 
 
 		 384 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  45.33 
 
 		 385 aa  308  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  43.6 
 
 		 385 aa  306  6e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3719  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 353 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  50 
 
 		 386 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  46.34 
 
 		 409 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.01 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  48.25 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  45.05 
 
 		 385 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  46.28 
 
 		 373 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  46.07 
 
 		 409 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  46.07 
 
 		 397 aa  304  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  45.38 
 
 		 394 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.35 
 
 		 398 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  47.77 
 
 		 378 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  46.03 
 
 		 381 aa  303  6.000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  45.81 
 
 		 409 aa  302  1e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  48.36 
 
 		 394 aa  300  3e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  46.01 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.73 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  45.73 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  45.73 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  45.73 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  45.73 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  48.75 
 
 		 395 aa  297  2e-79  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1927  multidrug efflux transport protein EefA  46.01 
 
 		 373 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000645896 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  45.43 
 
 		 425 aa  296  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  46.09 
 
 		 428 aa  296  6e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>