More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2836 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 446 aa  884    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  98.88 
 
 		 446 aa  873    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  77.97 
 
 		 480 aa  549  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2112  RND family efflux transporter MFP subunit  58.47 
 
 		 450 aa  420  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.5 
 
 		 393 aa  356  5e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  49.61 
 
 		 392 aa  351  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  49.86 
 
 		 386 aa  341  1e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.78 
 
 		 422 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  49.45 
 
 		 400 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  49.17 
 
 		 405 aa  335  1e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.03 
 
 		 433 aa  334  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  49.87 
 
 		 400 aa  334  2e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  51.09 
 
 		 394 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  48.28 
 
 		 382 aa  333  3e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2967  multidrug resistance protein  54.57 
 
 		 415 aa  333  5e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  47.54 
 
 		 379 aa  332  8e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  48.1 
 
 		 382 aa  332  8e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  50.28 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  48.45 
 
 		 394 aa  330  3e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  47.28 
 
 		 382 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  47.28 
 
 		 382 aa  327  3e-88  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01888  drug efflux lipoprotein  52.54 
 
 		 409 aa  325  1e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.524066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.75 
 
 		 379 aa  325  1e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.05 
 
 		 381 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  47.09 
 
 		 384 aa  323  5e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.27 
 
 		 395 aa  323  5e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 		 381 aa  322  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01880  Secretion protein HlyD  50.29 
 
 		 383 aa  322  6e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.69 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 		 381 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  46.32 
 
 		 384 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  45.43 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3553  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  50.45 
 
 		 378 aa  320  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  45.41 
 
 		 386 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  49.87 
 
 		 399 aa  317  3e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2894  RND family efflux transporter MFP subunit  47.29 
 
 		 397 aa  317  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.781676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  45.6 
 
 		 442 aa  316  4e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  48.61 
 
 		 400 aa  316  6e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  46.03 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  46.03 
 
 		 395 aa  315  7e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  49.17 
 
 		 381 aa  315  7e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  46.03 
 
 		 388 aa  315  8e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.64 
 
 		 386 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  47.46 
 
 		 383 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  45.21 
 
 		 428 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0152  RND family efflux transporter MFP subunit  46.2 
 
 		 385 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  46.47 
 
 		 382 aa  311  1e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4090  secretion protein HlyD  50.14 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  48.6 
 
 		 387 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  45.91 
 
 		 397 aa  310  5e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  45.38 
 
 		 383 aa  310  5e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0031  RND family efflux transporter MFP subunit  47.08 
 
 		 386 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000318769  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51550  multidrug efflux pump membrane fusion protein  49.17 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0131  RND family efflux transporter MFP subunit  46.87 
 
 		 383 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000302028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1335  RND family efflux transporter MFP subunit  48.28 
 
 		 385 aa  306  6e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3586  RND family efflux transporter MFP subunit  44.22 
 
 		 386 aa  306  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4006  RND family efflux transporter MFP subunit  44.22 
 
 		 386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  44.18 
 
 		 395 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1280  secretion protein HlyD  47.38 
 
 		 385 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0347794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01755  hypothetical protein  48.7 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0504  efflux transporter, RND family, MFP subunit  50.42 
 
 		 399 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196433  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  45.04 
 
 		 385 aa  302  7.000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  45.83 
 
 		 409 aa  302  8.000000000000001e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  45.66 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  45.57 
 
 		 409 aa  301  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  46.47 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  45.57 
 
 		 397 aa  301  2e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.28 
 
 		 405 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  44.76 
 
 		 385 aa  300  3e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  47.9 
 
 		 431 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  45.38 
 
 		 381 aa  299  5e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1836  multidrug efflux transport protein EefA  46.63 
 
 		 373 aa  299  5e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000609578 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  45.31 
 
 		 409 aa  299  7e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  47.34 
 
 		 390 aa  298  9e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 		 406 aa  298  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  44.48 
 
 		 385 aa  298  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.18 
 
 		 410 aa  297  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2238  secretion protein HlyD  45.45 
 
 		 431 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  46.05 
 
 		 405 aa  296  5e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  46.3 
 
 		 412 aa  296  7e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 424 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  47.38 
 
 		 423 aa  295  1e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  46.01 
 
 		 385 aa  294  2e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.08 
 
 		 396 aa  294  2e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  46.5 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  46.5 
 
 		 424 aa  295  2e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.96 
 
 		 403 aa  293  3e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>