More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2901 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 394 aa  781    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  60.16 
 
 		 405 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  45.04 
 
 		 383 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  43.48 
 
 		 412 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.17 
 
 		 371 aa  271  2e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  43.28 
 
 		 412 aa  270  4e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  40.4 
 
 		 400 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  39.64 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  42.54 
 
 		 427 aa  260  3e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  39.95 
 
 		 407 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.04 
 
 		 383 aa  255  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  43.02 
 
 		 425 aa  255  9e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  43.02 
 
 		 445 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.03 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  43.42 
 
 		 422 aa  253  5.000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.13 
 
 		 560 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  41.82 
 
 		 415 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  42.57 
 
 		 404 aa  249  8e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  43.43 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  42.86 
 
 		 397 aa  248  1e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  39.73 
 
 		 411 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4007  secretion protein HlyD  40.68 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.430649  normal  0.0665893 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.51 
 
 		 411 aa  243  3.9999999999999997e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  37.92 
 
 		 405 aa  241  1e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  39.89 
 
 		 395 aa  240  2.9999999999999997e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  41.06 
 
 		 428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  40.44 
 
 		 398 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  39.4 
 
 		 410 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4303  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.9 
 
 		 386 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  41.51 
 
 		 381 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  43.01 
 
 		 410 aa  239  9e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  39.19 
 
 		 391 aa  238  1e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.79 
 
 		 392 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  43.09 
 
 		 412 aa  237  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  41.05 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  42.45 
 
 		 415 aa  237  2e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  38.92 
 
 		 405 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.21 
 
 		 422 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.45 
 
 		 433 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  40.46 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.28 
 
 		 415 aa  234  3e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  38.99 
 
 		 412 aa  233  3e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  37.64 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  40.23 
 
 		 434 aa  230  4e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  38.8 
 
 		 441 aa  229  5e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  38.2 
 
 		 430 aa  229  5e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.56 
 
 		 401 aa  229  5e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  37.76 
 
 		 409 aa  228  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  35.52 
 
 		 407 aa  228  2e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  37.76 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  37.5 
 
 		 409 aa  227  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3047  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.22 
 
 		 396 aa  227  3e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.376069  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 384 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  37.5 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  36.53 
 
 		 385 aa  227  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  38.26 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  38.26 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4427  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 384 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123796 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  38.26 
 
 		 385 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  37.08 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 426 aa  226  6e-58  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  36.53 
 
 		 385 aa  226  7e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  37.11 
 
 		 388 aa  226  8e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.91 
 
 		 422 aa  225  1e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.53 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  37.84 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  36.53 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  36.53 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.02 
 
 		 393 aa  224  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  36.53 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 386 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1386  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.62 
 
 		 384 aa  223  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.178254 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  38.62 
 
 		 428 aa  223  4e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  36.27 
 
 		 385 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4337  RND family efflux transporter MFP subunit  38.62 
 
 		 384 aa  223  6e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.235617 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  38.32 
 
 		 425 aa  222  8e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  36.27 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  36.27 
 
 		 385 aa  222  9e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.08 
 
 		 394 aa  221  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 403 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  38.1 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  38.1 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.78 
 
 		 469 aa  220  3e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  37.87 
 
 		 385 aa  221  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  38.8 
 
 		 381 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.78 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  34.27 
 
 		 403 aa  219  5e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  38.59 
 
 		 412 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  38.59 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  35.81 
 
 		 434 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  37.99 
 
 		 382 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  40.47 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3527  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.91 
 
 		 446 aa  218  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  37.83 
 
 		 418 aa  218  1e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>