More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1229 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  100 
 
 		 428 aa  874    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  69.69 
 
 		 445 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  69.69 
 
 		 425 aa  513  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  64.31 
 
 		 427 aa  484  1e-135  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  56.12 
 
 		 441 aa  437  1e-121  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  54.92 
 
 		 412 aa  396  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  52.83 
 
 		 560 aa  394  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  56.71 
 
 		 412 aa  384  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  54.21 
 
 		 407 aa  379  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  56.93 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  52.42 
 
 		 405 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1391  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.66 
 
 		 401 aa  309  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.217202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  41.03 
 
 		 394 aa  266  5.999999999999999e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.83 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  39.39 
 
 		 411 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  37.28 
 
 		 383 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  39.5 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  38.11 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  38.11 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  37.12 
 
 		 405 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  37.98 
 
 		 400 aa  232  1e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 		 422 aa  229  6e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  36.26 
 
 		 425 aa  229  8e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  37.39 
 
 		 420 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.39 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.39 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.39 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.39 
 
 		 420 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  37.11 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.84 
 
 		 410 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  33.77 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  36.94 
 
 		 412 aa  225  1e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  36.29 
 
 		 412 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4070  secretion protein HlyD  38.46 
 
 		 405 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.409958  normal  0.154431 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.14 
 
 		 411 aa  224  3e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 420 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  36.83 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  36.83 
 
 		 424 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  37.11 
 
 		 431 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2656  RND family efflux transporter MFP subunit  37.25 
 
 		 432 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.444245  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  35.07 
 
 		 405 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  36.96 
 
 		 432 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 412 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  36.13 
 
 		 412 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  37.5 
 
 		 376 aa  218  1e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.78 
 
 		 393 aa  217  4e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  36.1 
 
 		 418 aa  215  9e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  36.84 
 
 		 398 aa  214  2.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.75 
 
 		 422 aa  213  5.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6680  RND family efflux transporter MFP subunit  36.1 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal  0.121297 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  32.27 
 
 		 395 aa  212  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.47 
 
 		 371 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  32.69 
 
 		 388 aa  211  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  35.16 
 
 		 428 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  33.78 
 
 		 395 aa  211  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0478  RND family efflux transporter MFP subunit  36.78 
 
 		 416 aa  209  7e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  normal  0.0228976 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  34.45 
 
 		 407 aa  209  8e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4061  RND family efflux transporter MFP subunit  33.7 
 
 		 383 aa  209  8e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000265031  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  32.96 
 
 		 434 aa  208  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.24 
 
 		 383 aa  207  3e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.55 
 
 		 436 aa  206  9e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  31.36 
 
 		 404 aa  205  1e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3911  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.84 
 
 		 395 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  36.25 
 
 		 434 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  34.19 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3816  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0409403 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03361  multidrug resistance efflux transporter  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0200  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03314  hypothetical protein  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3999  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4873  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3715  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00203932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0204  multidrug efflux system protein MdtE  34.34 
 
 		 385 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0378135 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  32.62 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3258  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.55 
 
 		 410 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.110627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3923  multidrug efflux system protein  33.88 
 
 		 387 aa  203  5e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.87 
 
 		 433 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3863  RND family efflux transporter MFP subunit  35.6 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.52 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  35.69 
 
 		 430 aa  201  9.999999999999999e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  34.62 
 
 		 400 aa  200  3e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  34.12 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2866  secretion protein HlyD  33.52 
 
 		 400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.21396  normal  0.0804187 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2160  secretion protein HlyD  34.45 
 
 		 391 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.36 
 
 		 424 aa  199  7e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.38 
 
 		 469 aa  199  9e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.17 
 
 		 422 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2192  RND family efflux transporter MFP subunit  33.24 
 
 		 408 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2614  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.94 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.34834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  36.34 
 
 		 403 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.79 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2041  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.35 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0718692  normal  0.0182823 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  31.16 
 
 		 394 aa  197  3e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  32.1 
 
 		 390 aa  197  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  33.51 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>