More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4636 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  100 
 
 		 403 aa  796    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.52 
 
 		 405 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  42.03 
 
 		 404 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  41.29 
 
 		 400 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  40.62 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  40.62 
 
 		 397 aa  243  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  39.21 
 
 		 383 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  39.11 
 
 		 411 aa  237  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  38.12 
 
 		 412 aa  237  3e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0581  RND family efflux transporter MFP subunit  37.77 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  40.21 
 
 		 391 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.78 
 
 		 560 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  37.47 
 
 		 394 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  40.82 
 
 		 398 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.56 
 
 		 410 aa  223  6e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3800  RND family efflux transporter MFP subunit  37.04 
 
 		 404 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.582867  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1458  RND family efflux transporter MFP subunit  38.24 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.235103  hitchhiker  0.000537348 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  37.53 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.45 
 
 		 411 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  40.73 
 
 		 412 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  38.79 
 
 		 381 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  35.34 
 
 		 405 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  37.36 
 
 		 407 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  35.2 
 
 		 405 aa  213  4.9999999999999996e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  37.47 
 
 		 412 aa  213  5.999999999999999e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  36.59 
 
 		 386 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  37.18 
 
 		 412 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 434 aa  210  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.34 
 
 		 423 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 445 aa  210  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.72 
 
 		 394 aa  210  4e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  37.54 
 
 		 425 aa  210  4e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.34 
 
 		 469 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0849  secretion protein HlyD  35.68 
 
 		 441 aa  209  5e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.27 
 
 		 422 aa  209  6e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 433 aa  209  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.36 
 
 		 422 aa  209  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  37.17 
 
 		 410 aa  209  8e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.03 
 
 		 395 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  36.7 
 
 		 392 aa  207  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1870  secretion protein HlyD  34.81 
 
 		 428 aa  207  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  37.96 
 
 		 428 aa  207  3e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  37.19 
 
 		 426 aa  206  6e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.29 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1356  AcrA/E family efflux transporter MFP subunit  34.36 
 
 		 407 aa  205  9e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  35.03 
 
 		 428 aa  205  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  36.72 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  36.58 
 
 		 388 aa  204  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  36.58 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  36.58 
 
 		 395 aa  204  3e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  35.39 
 
 		 379 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 382 aa  203  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1886  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.33 
 
 		 379 aa  203  5e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0158662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3367  RND family efflux transporter MFP subunit  34.86 
 
 		 480 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.324035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1117  secretion protein HlyD  38.57 
 
 		 367 aa  203  5e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3837  RND family efflux transporter MFP subunit  37.5 
 
 		 382 aa  203  5e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  37.5 
 
 		 400 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.81 
 
 		 395 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.61 
 
 		 393 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.72 
 
 		 383 aa  202  9.999999999999999e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4385  RND family efflux transporter MFP subunit  36.99 
 
 		 381 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.912914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0285  RND family efflux transporter MFP subunit  37.22 
 
 		 386 aa  200  3e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.884794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4046  RND family efflux transporter MFP subunit  37.21 
 
 		 382 aa  201  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6029  acriflavin resistance protein A  33.33 
 
 		 411 aa  200  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  37.03 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0090  RND family efflux transporter MFP subunit  35.9 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3493  RND family efflux transporter MFP subunit  38.81 
 
 		 381 aa  200  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  37.06 
 
 		 415 aa  199  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2644  RND family efflux transporter MFP subunit  37.93 
 
 		 385 aa  199  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4693  multidrug resistance protein AcrA/AcrE family  37.03 
 
 		 382 aa  199  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  37.24 
 
 		 442 aa  199  7e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  36.6 
 
 		 397 aa  199  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  33.51 
 
 		 396 aa  199  7e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2325  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.12 
 
 		 446 aa  199  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.116121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  37.24 
 
 		 383 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.98 
 
 		 390 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.122287 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  35.53 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0506  acriflavine resistance protein A  35.53 
 
 		 409 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.951175  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.7 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4251  RND family efflux transporter MFP subunit  36.71 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.397426  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2836  RND family efflux transporter MFP subunit  38.12 
 
 		 446 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.113713  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  36.5 
 
 		 400 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  37.03 
 
 		 397 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  39.82 
 
 		 376 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4212  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.71 
 
 		 381 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00414  multidrug efflux system  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0539  acriflavine resistance protein A  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3147  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.035839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00419  hypothetical protein  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3153  RND family efflux transporter MFP subunit  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0497  acriflavine resistance protein A  35.28 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  35.69 
 
 		 441 aa  197  3e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  33.51 
 
 		 396 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0553  acriflavine resistance protein A  35.28 
 
 		 409 aa  197  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3499  RND family efflux transporter MFP subunit  40.68 
 
 		 395 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0344164  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  35.71 
 
 		 425 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3715  RND family efflux transporter MFP subunit  36.7 
 
 		 382 aa  196  7e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.970475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 447 aa  196  7e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1990  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.21 
 
 		 392 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.759025  normal  0.937313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  36.03 
 
 		 394 aa  196  8.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>