More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_1616 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1616  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  100 
 
 
397 aa  768    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0928775 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1520  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  84.96 
 
 
395 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1543  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  84.21 
 
 
395 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.518401 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4767  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  87.04 
 
 
399 aa  590  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321733  normal  0.815881 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1142  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  86.54 
 
 
400 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1598  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  86.13 
 
 
400 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.671811  normal  0.334674 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1622  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  86.54 
 
 
400 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2057  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.94 
 
 
399 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.408634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1889  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.94 
 
 
399 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.169622  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2445  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  75.99 
 
 
399 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1903  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.94 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00844359  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0843  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.41 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.427222  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1662  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.41 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.018049  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0317  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  72.41 
 
 
399 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00333189  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3269  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  60 
 
 
396 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38395  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  61.87 
 
 
396 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1361  periplasmic multidrug efflux lipoprotein precursor  57.77 
 
 
389 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.72 
 
 
393 aa  325  7e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  53.66 
 
 
393 aa  325  8.000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  52.57 
 
 
415 aa  322  8e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0889  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.93 
 
 
384 aa  320  3e-86  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000000756331  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  51.39 
 
 
415 aa  302  6.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  50.26 
 
 
398 aa  299  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.04 
 
 
423 aa  296  4e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  47.44 
 
 
469 aa  295  9e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2937  RND family efflux transporter MFP subunit  48.23 
 
 
391 aa  294  2e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0383787 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  43.57 
 
 
405 aa  291  1e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.48 
 
 
391 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.297905 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2482  RND family efflux transporter MFP subunit  47.51 
 
 
391 aa  289  6e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2314  RND family efflux transporter MFP subunit  48.2 
 
 
391 aa  287  2e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  45.58 
 
 
410 aa  285  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  45.78 
 
 
430 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2893  secretion protein HlyD  45.98 
 
 
385 aa  281  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.127871  normal  0.371656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  48.09 
 
 
424 aa  281  2e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60850  multidrug efflux RND membrane fusion protein  46.15 
 
 
387 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  42.6 
 
 
406 aa  279  6e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2758  secretion protein HlyD  44 
 
 
385 aa  279  6e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.215327  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  47.09 
 
 
430 aa  279  8e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  44.23 
 
 
428 aa  276  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.86 
 
 
411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0288  RND family efflux transporter MFP subunit  44.81 
 
 
381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  44.32 
 
 
412 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.93 
 
 
422 aa  271  1e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  41.6 
 
 
392 aa  268  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  43.65 
 
 
405 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5858  RND family efflux transporter MFP subunit  45.82 
 
 
409 aa  266  2.9999999999999995e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.965315  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  44.26 
 
 
381 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.64 
 
 
395 aa  264  2e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0497  RND family efflux transporter MFP subunit  44.85 
 
 
423 aa  263  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.479969  normal  0.274836 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5240  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexC precursor  46.48 
 
 
387 aa  261  1e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  45.24 
 
 
434 aa  261  1e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  43.48 
 
 
425 aa  261  2e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.35 
 
 
433 aa  261  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2283  secretion protein HlyD  44.44 
 
 
386 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00947214 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2427  RND family efflux transporter MFP subunit  45.45 
 
 
380 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.412114  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2817  multidrug efflux RND membrane fusion protein MexC  44.5 
 
 
378 aa  256  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.182401  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2256  RND family efflux transporter MFP subunit  46.38 
 
 
404 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.91 
 
 
383 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1018  RND family efflux transporter MFP subunit  43.99 
 
 
420 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0680  RND family efflux transporter MFP subunit  43.94 
 
 
420 aa  255  9e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.557778  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0315  RND family efflux transporter MFP subunit  43.99 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4472  RND family efflux transporter MFP subunit  41.39 
 
 
447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0821721 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0854  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  43.99 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719076  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0525  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  40.37 
 
 
442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0610  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  43.99 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.80065  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0859  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  43.72 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2445  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  43.99 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0058  multidrug efflux periplasmic linker protein BpeA  43.99 
 
 
420 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0523497  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5599  secretion protein HlyD  41.76 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5963  RND family efflux transporter MFP subunit  41.76 
 
 
418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0363452 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  47.23 
 
 
400 aa  253  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6607  HlyD family secretion protein  44.32 
 
 
418 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.032922  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  43.41 
 
 
400 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3714  RND family efflux transporter MFP subunit  43.41 
 
 
408 aa  253  5.000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132208 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2867  RND family efflux transporter MFP subunit  42.02 
 
 
401 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.966 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  42.78 
 
 
395 aa  252  8.000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6463  RND family efflux transporter MFP subunit  41.42 
 
 
418 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.984064  normal  0.35165 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2887  RND family efflux transporter MFP subunit  45.77 
 
 
430 aa  251  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303028  normal  0.0961096 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  42.93 
 
 
433 aa  251  2e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.16 
 
 
398 aa  251  2e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  39.5 
 
 
394 aa  250  3e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  43.14 
 
 
426 aa  250  3e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2638  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 
424 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0688  RND family efflux transporter MFP subunit  44.44 
 
 
431 aa  250  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.921638  normal  0.624256 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  46.04 
 
 
367 aa  249  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1999  secretion protein HlyD  43.48 
 
 
424 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.931394  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2609  RND family efflux transporter MFP subunit  43.48 
 
 
424 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  40.05 
 
 
397 aa  249  6e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2529  RND family efflux transporter MFP subunit  44.19 
 
 
432 aa  249  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.210606 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3327  RND family efflux transporter MFP subunit  40.56 
 
 
441 aa  247  2e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  41.07 
 
 
396 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3651  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.56 
 
 
441 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  41.47 
 
 
385 aa  248  2e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  43.16 
 
 
412 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  43.16 
 
 
412 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  40.79 
 
 
379 aa  247  3e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2593  multidrug resistance protein, AcrA/AcrE family  44.91 
 
 
386 aa  246  4e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.800698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  41.07 
 
 
396 aa  246  4e-64  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2680  secretion protein HlyD  44.05 
 
 
393 aa  246  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.957988  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1448  secretion protein HlyD  47.01 
 
 
376 aa  246  4e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>