More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0375 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0375  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 404 aa  809    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.141788  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0305  HlyD family secretion protein  85.64 
 
 		 397 aa  610  1e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0291  HlyD family secretion protein  85.4 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0825  RND family efflux transporter MFP subunit  44.13 
 
 		 383 aa  288  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.82 
 
 		 405 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2901  RND family efflux transporter MFP subunit  43.4 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4636  secretion protein HlyD  42.52 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0828  RND family efflux transporter MFP subunit  38.59 
 
 		 396 aa  247  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0011  acriflavin resistance lipoprotein A precursor  40.46 
 
 		 398 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.511373  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0932  precursor of drug resistance protein  40.12 
 
 		 396 aa  244  3e-63  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.4 
 
 		 383 aa  243  3e-63  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000507809  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1593  secretion protein HlyD  40.29 
 
 		 400 aa  241  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000034507  unclonable  0.000000261884 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3745  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.9 
 
 		 423 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3422  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.9 
 
 		 469 aa  238  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  40.16 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1701  secretion protein HlyD  38.32 
 
 		 412 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.17328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0569  RND family efflux transporter MFP subunit  39.95 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3440  secretion protein HlyD  39.63 
 
 		 415 aa  231  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2066  secretion protein HlyD  40.63 
 
 		 428 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.567226  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3399  RND family efflux transporter MFP subunit  38.5 
 
 		 406 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.852955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1011  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.96 
 
 		 395 aa  226  4e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.279031  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0809  secretion protein HlyD  39.26 
 
 		 392 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.165865 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  34.72 
 
 		 427 aa  226  8e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1127  RND family efflux transporter MFP subunit  35.79 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295973  unclonable  0.0000000230672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3063  secretion protein HlyD  36.72 
 
 		 412 aa  223  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000572272  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4148  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.22 
 
 		 560 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3680  secretion protein HlyD family protein  37.31 
 
 		 405 aa  221  9.999999999999999e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0389  RND family efflux transporter MFP subunit  40.41 
 
 		 434 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2607  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.17 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.113369  normal  0.140751 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1849  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.54 
 
 		 422 aa  221  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00425578 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0689  secretion protein HlyD  34.7 
 
 		 411 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.95 
 
 		 393 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.143252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0501  RND family efflux transporter MFP subunit  40.3 
 
 		 430 aa  221  3e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0692  secretion protein HlyD  36.03 
 
 		 412 aa  219  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000417324  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2369  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.36 
 
 		 433 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.137399  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5503  RND family efflux transporter MFP subunit  38.82 
 
 		 445 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00522591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00481  multidrug resistance protein  35.37 
 
 		 434 aa  218  2e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0647  RND family efflux transporter MFP subunit  38.82 
 
 		 425 aa  217  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3067  acriflavine resistance protein A  34.57 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3207  RND family efflux transporter MFP subunit  34.57 
 
 		 395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.474787  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0331  RND family efflux transporter MFP subunit  39.1 
 
 		 394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.109026  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2880  multidrug efflux protein  34.95 
 
 		 388 aa  216  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.876487 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4582  acriflavine resistance protein E  39.2 
 
 		 385 aa  216  7e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153462  normal  0.314671 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2697  multidrug resistance protein  40.69 
 
 		 400 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3588  secretion protein HlyD  40.73 
 
 		 415 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0910  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.18 
 
 		 393 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3560  acriflavine resistance protein E  38.92 
 
 		 385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0550362  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0441  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.92 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3750  acriflavine resistance protein E  38.92 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00329123  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0410  RND family efflux transporter MFP subunit  37.8 
 
 		 407 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3458  acriflavine resistance protein E  38.92 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000310651  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0441  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 385 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.693626 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1921  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.35 
 
 		 394 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0518  secretion protein HlyD  37.87 
 
 		 412 aa  213  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2665  RND family efflux transporter MFP subunit  38.01 
 
 		 410 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0547  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.91 
 
 		 410 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3648  acriflavine resistance protein E  38.64 
 
 		 385 aa  212  7.999999999999999e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3238  secretion protein HlyD  36.41 
 
 		 393 aa  211  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03123  cytoplasmic membrane lipoprotein  38.64 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3241  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.76 
 
 		 398 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03074  hypothetical protein  38.64 
 
 		 385 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0551  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.87 
 
 		 411 aa  210  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0318  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.31 
 
 		 436 aa  210  3e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.199682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0841  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.03 
 
 		 393 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.85215 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2338  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.78 
 
 		 373 aa  210  4e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2035  secretion protein HlyD  39.68 
 
 		 430 aa  210  4e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.789986  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0708  membrane fusion protein, RND efflux pump  38.03 
 
 		 410 aa  209  7e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3689  acriflavine resistance protein E  39.29 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.10776 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3655  acriflavine resistance protein E  39.29 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369196 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3582  acriflavine resistance protein E  39.29 
 
 		 385 aa  209  1e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.372723  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3492  RND family efflux transporter MFP subunit  36.22 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.474299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5940  HlyD family secretion protein  37.2 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591185  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3699  RND family efflux transporter MFP subunit  33.61 
 
 		 390 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2941  RND family efflux transporter MFP subunit  36.98 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.224778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0943  RND family efflux transporter MFP subunit  36.67 
 
 		 397 aa  208  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1074  RND family efflux transporter MFP subunit  34.32 
 
 		 405 aa  207  2e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.151684  normal  0.62301 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1776  CmeA  36.86 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000125677  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1070  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.46 
 
 		 397 aa  206  5e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00558937  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1418  secretion protein HlyD  37.8 
 
 		 400 aa  206  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1742  RND efflux system membrane fusion protein  34 
 
 		 403 aa  206  6e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0860359  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3704  RND family efflux transporter MFP subunit  37.75 
 
 		 379 aa  206  6e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.596756 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003895  membrane fusion protein of RND family multidrug efflux pump  34.83 
 
 		 379 aa  206  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00341624  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4831  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.97 
 
 		 424 aa  206  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.630346  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6204  RND family efflux transporter MFP subunit  38.64 
 
 		 412 aa  206  8e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.103192  hitchhiker  0.00610274 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0287  acridine efflux pump  37.03 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2050  secretion protein HlyD  36.98 
 
 		 426 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0307  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.03 
 
 		 371 aa  205  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5837  secretion protein HlyD  38.64 
 
 		 412 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91911  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0323  RND family efflux transporter MFP subunit  38.84 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.827014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1229  RND efflux system membrane fusion protein  34.88 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0847833 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3583  acriflavine resistance protein E  38.99 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0530  RND family efflux transporter MFP subunit  37.13 
 
 		 394 aa  204  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.727313  normal  0.0367065 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3435  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.27 
 
 		 399 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.169321  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1189  secretion protein HlyD  35.43 
 
 		 381 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.563711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3601  secretion protein HlyD  36.63 
 
 		 386 aa  203  4e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.804898  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1026  RND family efflux transporter MFP subunit  37.08 
 
 		 384 aa  203  4e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.933063 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0395  acriflavine resistance protein A  36.51 
 
 		 409 aa  203  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1622  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.73 
 
 		 415 aa  203  5e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.1162  normal  0.0945961 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4027  secretion protein HlyD  39.07 
 
 		 399 aa  203  5e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.278871  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05530  RND multidrug efflux membrane fusion protein MexA precursor  38.29 
 
 		 383 aa  203  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>